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探讨微小RNA-3960(miR-3960)在过量全反式维甲酸(atRA)诱导腭裂小鼠模型中的作用。
方法6只ICR系受孕雌鼠随机分为对照组与实验组，每组3只。在E14.5，对实验组小鼠用atRA灌胃1次，对照组以相应体积植物油灌胃1次。建立过量atRA诱导腭裂小鼠模型，并收集腭突组织。采用qRT-PCR检测miR-3960在对照组和实验组腭突中的表达。利用miRBase分析miR-3960的序列特征。利用TargetScanMouse Prediction of microRNA targets预测miR-3960的靶基因。利用DAVID v6.8数据库，对miR-3960预测的靶基因进行生物信息学分析。
结果miR-3960在实验组中表达上调。通过miRBase分析，只获得miR-3960在2个物种中的序列，并且mmu-miR-3960与hsa-miR-3960的序列一致。预测的靶基因共有320个，功能主要富集在细胞增殖、细胞分化、胚胎发育和组织发育等(P<0.05)，信号通路主要富集在钙信号通路、cAMP信号通路和cGMP-PKG信号通路等(P<0.05)。
结论在过量atRA诱导的腭裂小鼠中，上调的miR-3960可能是通过抑制腭突间充质细胞的增殖和分化而导致腭裂的发生。