【摘 要】
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目的了解结核病患者血清中Small RNA(sRNA)表达谱的特征,为从Small RNA角度探讨结核病发生、发展的调控机制奠定基础。方法采用Solexa深度测序技术得到包括miRNA、siRNA、piR
【基金项目】
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广东省自然科学基金(9151051501000003);国家十一五重大专项:结核病发病模式的研究项目(2008ZX10003-007)
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目的了解结核病患者血清中Small RNA(sRNA)表达谱的特征,为从Small RNA角度探讨结核病发生、发展的调控机制奠定基础。方法采用Solexa深度测序技术得到包括miRNA、siRNA、piRNAr、RNAt、RNA、snRNA、snoRNAr、epeat associate sRNA、exon或intron降解片段等在内的所有Small RNA。通过与已知数据库进行比对、寻找样品与数据库之间在基因组位置上的o-verlap等方法,对sRNA进行注释,同时选取没有被注释上的sRNA,使用华大自主开发的软件Mireap预测novel miRNA。结果非结核病组血清中发现109 630种、2 759 795条Small RNA,其中候选miRNA种数为84、候选miRNA总表达量为1 433;结核病组血清中发现97 614种1、452 119条Small RNA,其中候选miRNA种数为65、候选miRNA总表达量为755。结论结核病人与非结核病人血清中的Small RNA表达谱存在种类与数量上的差异。
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