石榴POD基因家族鉴定及生物信息学分析

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为解析石榴POD基因家族的特征,本研究利用生物信息学技术对石榴POD基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、二级结构、亚细胞定位、系统进化关系和保守基序等进行了预测分析.结果 表明,石榴中共鉴定出107个POD基因家族成员,其大部分为碱性蛋白、稳定蛋白和亲水性蛋白.蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲结构为主要构成元件.亚细胞定位表明POD蛋白主要分布在细胞质中.根据系统进化关系可分为11个亚族,每个亚族基因的数量不同,第5个亚族最多.聚在同一亚族POD蛋白的保守基序组成相似,其进化关系较近.研究结果为深入分析石榴POD基因的功能,揭示其调控石榴果实褐变的机理提供了科学依据.
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