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番荔枝枯果病主要危害嫩果的果皮和果实。发病初期，聚合浆果的各瓣上有小黄斑，发病果多在向阳面，病斑逐渐扩大旱假熟状，病果瓣迅速变紫褐色。在潮湿环境下，病果上的病斑表现为软腐，干燥环境下为干腐。病果变硬后，果柄也染病干枯，但不易断裂，不易脱落。在僵果的果瓣上，表面有很多小黑点，突破表皮。这些集生或散生的小黑点即病原菌的分生孢子器。潮湿环境下，小黑点缢出乳白色卷须状物，即分生孢子角。该病每年在5月和10月出现发病高峰。