髓母细胞瘤基因表达谱芯片关键基因的生物信息学分析

• 作 者: 刘敏 董强 唐圣桃 陶依然 吴铮 王鲲宇 王文
• 机 构: 首都医科大学宣武医院,河北北方学院,兰州大学第二医院,郴州市第一人民医院
• 出 处: 生命科学研究
• 发表日期: 2018年6期
• 关键词: 髓母细胞瘤(MB) 差异基因 蛋白质互作网络 生物信息学
• 基金项目: 国家自然科学基金资助项目(81573633)

筛选髓母细胞瘤(medulloblastoma,MB)发生发展的关键基因,可为MB分子机制的进一步研究提供生物信息学依据。本文通过下载GEO (Gene Expression Omnibus)数据库GSE50161原始数据,利用R语言对正常脑组织与髓母细胞瘤组织中差异表达的基因进行分析;通过生物信息学分析工具(DAVID、STRING和Cytoscape)对差异基因进行生物学功能和蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,并通过PPI筛选互作调控的关键基因。结果