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蓖麻的花序是与其产量直接相关的性状.为分析蓖麻单雌、标雌、两性系花序不同时期基因组DNA甲基化差异、寻找花序发育相关基因,本试验对4叶期、5叶期、主茎穗期及二级分枝开花期三类材料进行了甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)分析.结果 表明不同发育时期3种花序的甲基化存在差异,在4叶期、5叶期、主茎穗期、二级分枝开花期的总甲基化率分别为25.26％～31.95％、14.21％～16.35％、16.58％～17.32％和21.9％～27.68％,半甲基化率分别为13.31％～15.50％、6.96％～8.93％、9.11％～9.99％和10.06％～12.58％,全甲基化率分别为11.96％～16.46％、7.08％～7.42％、6.70％～9.33％和10.69％～15.10％;此外,发现了4个可能与蓖麻花序发育相关的基因,同源序列分别编码过氧化物酶体生物合成蛋白6(LOC8287160)、GABA转运蛋白(LOC8287746)、多效耐药蛋白1(LOC8284842)和磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶(LOC8274135),为进一步研究蓖麻花序发育过程中DNA甲基化状况提供了参考.