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黏膜免疫系统是有肠相关淋巴组织、支气管相关淋巴组织及其他黏膜相关淋巴组织组成的免疫系统。包括肠道黏膜集合淋巴结、呼吸道和泌尿生殖道黏膜下层的淋巴小结和弥散型淋巴组织．含有丰富的B细胞、T细胞和巨噬细胞。黏膜相关淋巴组织不同于其他免疫系统，它是受黏膜表面的抗原物质刺激而形成的免疫系统。即是机体整个免疫系统的重要组成部分，同时具有独特功能的独立免疫系统。