基于生物信息学分析肝细胞癌miRNA的差异表达及其功能预测

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目的:基于生物信息学分析肝细胞癌miRNA的差异表达及其功能预测,为肝细胞癌的早期诊断和干预治疗提供新的思路。方法:利用GEO数据库获取肝细胞癌非编码RNA表达数据集,使用R(v 3.6.0)通过limma包、pheatmap包筛选差异miRNA并进行可视化。对差异miRNA进行转录因子预测,同时进行信号通路分析和GO富集分析并进行可视化。结果:在肝细胞癌组织中共筛选出37个miRNA表达具有差异,得到比较有意义的转录因子分别为EGR1、POU2F1、SP1、NKX6-1、MEF2A、FOXA1、SP4、
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