【摘 要】
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目的 采用全基因组寡核苷酸微阵列芯片,检测神经母细胞瘤SP细胞与非SP细胞基因表达的差异,从基因层面探讨SP细胞与肿瘤转移相关性的可能分子机制.方法 培养人神经母细胞瘤系SK-N-SH,检测条件稳定后以流式细胞仪行SP细胞分选,将分得的SP及非SP细胞采用RNA表达谱芯片分别检测其基因表达情况,筛选出差异表达基因,并加以分析.结果 在人类全基因组中,共筛选出差异基因位点53 544个,其中表达上调
【机 构】
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201102上海,复旦大学附属儿科医院外科,201102上海,复旦大学附属儿科医院外科,201102上海,复旦大学附属儿科医院外科,201102上海,复旦大学附属儿科医院外科
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目的 采用全基因组寡核苷酸微阵列芯片,检测神经母细胞瘤SP细胞与非SP细胞基因表达的差异,从基因层面探讨SP细胞与肿瘤转移相关性的可能分子机制.方法 培养人神经母细胞瘤系SK-N-SH,检测条件稳定后以流式细胞仪行SP细胞分选,将分得的SP及非SP细胞采用RNA表达谱芯片分别检测其基因表达情况,筛选出差异表达基因,并加以分析.结果 在人类全基因组中,共筛选出差异基因位点53 544个,其中表达上调2倍以上的基因有3 453个,表达下调2倍以上的基因有1 256个.采用Signal interaction network分析方法对所有表达差异在2倍以上的基因进行互相作用网络分析得到MAPK3/ERK1是差异基因关系网中最关键的基因,其他的还包括MAPK14/p38a等.结论 MAPK信号转导通路关键组分MAPK3/ERK1、MAPK14/p38a在SP细胞中高表达,可能是SP细胞与肿瘤转移高相关性的关键分子通路。
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