鸟类基因组进化树的构建与分析

来源 :计算生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:menghuilong
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文选取了47种鸟类的基因组作为研究对象,根据靶定下一代DNA测序技术(targeted next-generation DNA sequencing)得到的394个保守片段的DNA序列数据,统计了从9联体到14联体的频数及其频率,基于k联体(k-mer)非联配算法得到了任意两种鸟类之间k联体的距离矩阵,并运用邻接(Neighbor-Joining)法构建了47种鸟类的进化树,发现当k = 12时达到稳定。最后,通过将该树与Prum和Jarvis构建的进化树进行了比较,分析了鸟类的进化和分类. 结果发现三
其他文献
利用反向分子对接方法对E-低聚白藜芦醇化合物的杀菌机理进行研究。通过受体的直接药物设计方法,筛选得到来自MRSA的PBP2a蛋白(PDB ID:4CJN)匹配度最高的为对接受体蛋白。基
习近平总书记提出的"三严三实",既是共产党人最基本的政治品格和做人准则,又是党员干部的修身之本、为政之道、成事之要。作为党员领导干部,应以"三坚持"为引领,以做严实结合的行
20t6年以来,上海市公安边防支队在深入推进“两学一做”学习教育中,创新手段,通过引入“菜单式”党课,准确把握学习目标、问题导入、活动成效等关键环节,增强了学习的针对性、广泛
石油开采引起的大梯度、大范围地面沉降,不仅会破坏油井的生产设施,同时会影响周边环境和人们的生活。本文采用StaMPS技术,利用2007~2010年的21景L波段ALOS/PALSAR数据和2016
我喜欢乡村的节奏,每一回乡,就像离巢久了的鸟儿,落在那儿,被一种难以名状的力量覆盖,缓缓地、静静地,古老的乡村像一块沉积了千年的磁石,不管外界怎样的喧嚣,内心的尘垢都在那一瞬间剔除掉了。乡村,我的乡村,你的脚步不会慌乱,不会迷茫,不会在现代的包裹中逝去,她坚定地走着,内心的包容力量谁也不可小觑。  我不喜欢时下乡村会走向没落的荒诞论调,即使城市再无限制地扩延,也难以吞没乡村的 广袤。  行走于乡
蛋白质二级结构预测是计算生物学研究的重要领域。虽然现有优秀的机器学习方法的预测准确度已经超过80%,但是它们都有共同的缺陷:不能及时学习最新实测的蛋白质结构信息,不能
基因组学是当今生物信息学的核心领域之一,基因组学的两个主要研究方向是:以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能解读为目标的功能基因组学。在过去几十年,基因组
车载激光点云在城市道路资产管理、高精驾驶地图、农村宅基地调查、高速公路改扩建、智能交通等国家重大工程应用中发挥着非常重要的作用;然而,受道路环境复杂、定位信号受遮