帕金森病家系GDNF基因启动子测序及其CpG岛甲基化分析

来源 :徐州医学院 徐州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jyd965243
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目的:探讨GDNF基因启动子的变异或其CpG岛的异常甲基化与PD家系中PD发病的关系。   方法:从PD家系成员的外周血中提取全血DNA,应用引物设计软件针对第一启动子设计2对引物和3组甲基化和非甲基化引物,第二启动子区及第二外显子区设计1对引物和4组甲基化和非甲基化引物;应用聚合酶链反应(PCR)进行GDNF基因2个启动子扩增,并用基因测序技术进行测序,然后应用DNAstar软件进行序列变异分析。采用甲基化特异性PCR(MSP)技术扩增2个启动子区及第二外显子区的甲基化和非甲基化产物,并用琼脂糖凝胶电泳观察GDNF基因2个启动子区及第二外显子区CpG岛的甲基化情况。   结果:GDNF基因第一个启动子区发现了2个变异位点,是目前已知的多态位点,即rs2975100(3738C>T)和rs2075680(4141G>T),这2个多态位点不位于转录结合区;而第二个启动子区未发现变异。GDNF基因2个启动子区及第二外显子区的CpG岛上无异常甲基化。   结论:1.PD家系中PD的发病可能与GDNF基因第一启动子区的2个多态位点有关。2.PD家系中PD的发病与GDNF基因启动子突变无关。3.PD家系中PD的发病与GDNF基因CpG岛的异常甲基化无关。
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