铁矿类芽胞杆菌的多相分类学研究及铁矿硒矿土壤细菌多样性研究

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:super_sxw777
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
自然界中微生物数量多生存范围广,然而目前我们认识的微生物只是其中很小的一部分,因此,微生物的分类鉴定工作亟待发展,微生物的分类鉴定工作对于丰富生物资源以及人类生产应用具有重要意义。  为了研究铁矿土壤样品中细菌的多样性,本研究从湖南省张家界市某赤铁矿矿土中分离纯培养得到66株细菌。通过16S rRNA基因序列分析,这些菌株分布于伯克氏菌属(Burkholderia)、类芽胞杆菌属(Paenibacillus)、节杆菌属(Arthrobacter)、芽胞杆菌属(Bacillus)、链霉菌属(Strepto myces)、Lysinbacillus、Dyella、Leifsonnia这8个属,共27个种,其中优势种属是类芽胞杆菌属以及伯克氏菌属。其中菌株CY1T通过16S rRNA基因序列同源性分析表明,其与Paenibacillus chondroitinus DSM5051T的相似度最高为97.7%,与Paenibacilluspocheonensis KCTC13941T的相似度为97.4%,与Paenibacillus frigoriresistensJCM18141T的相似度为97.0%。然而CY1T与这三株菌株的DNA-DNA杂交结果最高仅为49%,这说明菌株CY1T很有可能是类芽胞杆菌属的一个新种。因此本研究利用多相分类学鉴定的方法确定菌株CY1T的分类学地位。  菌株CY1T是一株严格好氧的革兰氏阳性细菌,具有周生鞭毛,能运动,杆状,能够产生芽胞。菌株CY1T在营养肉汤固体培养基(NA)上培养2d后,菌落为乳白色,中等大小的圆形,表面光滑,边缘整齐,不透明。菌株CY1T的生长温度范围在4-37℃之间(最适温度为28℃),生长pH范围是5.0-8.0(最适pH为6.0-7.0)。菌株CY1T的NaCl耐受浓度在NA液体培养基中是0-1.5%(最适NaCl浓度为0%)。氧化酶和过氧化氢酶的活性均为阳性;能够水解吐温80、七叶灵;能够产生NH3和H2S;乙酰甲基醇(V.P.)实验和甲基红实验(M.R.)为阴性;不能水解淀粉、明胶、纤维素、吐温20、酪蛋白以及DNA;不能产吲哚;不具有硝酸盐还原性。菌株CY1T的主要脂肪酸(≥5%)是anteiso-C15∶0(63.4%), iso-C16∶0(11.7%),iso-C15∶0(6.8%)和C16∶0(5.8%),MK-7为主要呼吸醌,极性脂含量较高的是双磷脂酰甘油(DPG),磷脂酰乙醇胺(PE),磷脂酰甘油(PG),细胞壁肽聚糖成分是内消旋二氨基庚二酸(A1γ-meso-DAP),DNA G+C mol%为50.5 mol%。综合表型,化学分类学及基因型等结果,表明菌株CY1T为类芽胞杆菌属的一个新种,将其命名为铁矿类芽胞杆菌,即Paenibacillusferrarius sp.nov.,并将菌株送至韩国典型菌种保藏中心及中国典型培养物保藏中心保藏,保藏号为KCTC33419和CCTCC AB2013369。  类芽胞杆菌属广泛应用于植物病害防治及环境治理。为了进一步探索类芽胞杆菌在矿区土壤中的分布特点,本研究分析了课题组铁矿和硒矿土壤样品中细菌的多样性,发现类芽胞杆菌在铁矿和硒矿土壤样品中均有一定的分布,并且在某些土壤样品中是优势种属。本研究结果丰富了类芽胞杆菌属的多样性,为后续研究类芽胞杆菌属的菌种特性和应用价值提供了物质资源和实验参照。  除以上论文内容外,本人还参与了细菌中砷(As)氧化调控机制和细菌基因组分析的研究,主要是涉及到磷酸盐双组份调控系统对砷氧化的作用,进行了包括蛋白质表达体系的构建、蛋白质的诱导表达及纯化、凝胶阻滞实验(EMSA)及DNA足迹实验(DNA-Footprinting)、定量lacZ报告基因融合检测基因表达量等实验,该部分结果已在Frontiers in Microbiology和Standards in Genomic Sciences上正式发表(这部分内容未在论文中展示,只展示了发表的SCI论文的首页)。
其他文献
对混凝土材料的合理使用是保证工程稳定安全的一个重要方面。工程实际当中,混凝土材料往往受到多种荷载的共同作用,表现出复杂的力学特性,其受力损伤演化过程一直是力学、材
  "课后班"是随着社会经济发展出现的新鲜事物,因需求而存在,因利益而发展,因不规范而备受争议。为消除其存在的火灾隐患,使其健康发展,笔者在大量实地调查的基础上提出了一些有
  本文在介绍了常见可燃气体探测器的种类、原理和可燃气体探测系统组成架构的基础上,探讨了可燃气体探测系统的设计和运行的方法,分门别类地对不同场所使用的可燃气体探测器
Hfq(Host factor)是原核生物中广泛存在且高度保守的RNA伴侣蛋白,结构与真核生物Sm蛋白类似,通过参与ncRNAs(non-coding RNAs)与其靶标mRNAs的互作过程,在转录水平上进行调控。
根据已知大麦Gsp基因的保守序列设计特异引物,对17份北美栽培大麦材料和31份西藏野生大麦的Gsp基因进行了SNP分析。在此基础上,分析了栽培大麦Gsp基因的SNP变异与籽粒硬度之间的关系。同时,探讨了西藏野生大麦在大麦起源与进化中的地位。主要研究结果如下:1通过比对西藏的31份野生二棱和六棱大麦材料的Gsp基因序列,发现西藏野生大麦Gsp基因序列相似程度极高(同源性为99.15%)。然后将这些序
家蚕(Bombyx mori)起源于中国野桑蚕,这个过程经历了漫长的人工选择驯化,它们在形态、生长发育、产卵、产丝量以及飞行能力方面都存在着很大的差异。作为鳞翅目的模式昆虫,家蚕具有遗传资源丰富、世代短、易于实验室饲养、子代群体大等优点,与双翅目模式昆虫果蝇相比,家蚕的个体比较大,实验操作起来比较容易,并且家蚕的中枢神经系统中分泌细胞极为丰富,神经细胞相对比较大,在实验过程中便于更好的观察和研究。
  目的:研究高校青年教师职业压力与身心健康状况、应对方式现状及相互关系.方法:运用中文版付出-回报失衡问卷、简易应对方式问卷、Ever & Frese(2000)汉化后的身心状况量表
会议
校园心理剧是受莫雷诺心理剧理论启发在校园里应运而生的.本研究旨在将心理剧的技术和方法,运用到日常的心理课程以及对学生的心理辅导中,一方面丰富心理教学的方式和手段,促
截流工程是水利水电建设项目中至关重要的环节,它的成败直接影响着工程的工期和造价。截流的方式有多种,目前工程中应用最为普遍的是立堵截流,因为其具有较低的工程造价、较简的
本课题以湘江株洲航电枢纽扩建二线船闸工程为依托,采用三维数值模型对双线船闸灌泄水时引航道内非恒定流水力特性进行系统研究。为依托工程选择合理的引航道布置型式以及双