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为探索长爪沙鼠高脂血症易感的基因及其遗传标记,以用于培育新品系,同时获得长爪沙鼠高脂血症的发病机理,用高脂饲料连续饲喂4周三月龄雄性长爪沙鼠(体重50~70g),建立长爪沙鼠诱发型高脂血症模型。测定CHO/TC、LDL、HDL和TG等七项血液生化指标,制作肝脏病理切片。结果表明造模一周时动物血清TC、LDL-C和HDL-C均迅速升高,血清脂蛋白以LDL-C升高为主,且稳定到第四周,肝脏有明显的脂肪变性。利用血脂生化检测(TG、TC、LDL、HDL),血清脂蛋白琼脂糖电泳技术共对444只动物进行检测,结果自发高脂血症的发病率为10%-30%。病理切片显示高龄鼠腹壁脂肪增厚,患高脂血症个体(模型鼠)常规病理与高脂饲料诱发的三月龄鼠模型相似;肝脏切片染色显示有许多大小不等被油红着色的脂滴分布。相同的饲养条件(环境,饲料)下8月龄以上的中老年沙鼠TC,TG与7月龄及以下的沙鼠有显著差别(P<0.05)。长爪沙鼠中自发型高脂血症Ⅱa、Ⅱb、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ型的频率分别为14.8%、44.4%、14.8%、16.7%和3.7%,而高脂饲料诱发4周及以上的动物为Ⅴ型。正常组与高脂组动物肠菌DGGE图谱的条带均数分别为18.6条和15.2条,高脂动物的肠菌具有较高的相似指数,表明高脂血症影响了肠道生物区系结构,由此将动物肠道微生物检测与聚类分析作为评价模型的一种检测方法。 利用RT-PCR和RACE技术,以长爪沙鼠肝脏cDNA为模板克隆apoE与Icat两个基因全序列。其中apoE基因全长2077 bp,CDS区长约1135 bp,三个外显子,两个内含子,编码316个氨基酸(EU834053),经BLAST比较发现沙鼠与大鼠、小鼠、人和非人灵类apoE基因的CDS区的同源性达到了86%、93.6%、79.2%和78%。在444只长爪沙鼠中,用PCR-SSCP检测到三个SNP:97位(C→T),781位(G→T),1774位(A→T)。三个位点的等位基因数都为2个,遗传方式基本符合孟德尔定律;期望杂合度分别是0.063、0.501、0.499,全群平均为0.354;PIC分别是0.061、0375、0.374,全群平均0.270,表明在C97T上属于低度多态,在G781T和A1774T上属于高度多态。遗传效应分析表明,年龄、性别、营养条件及饲养环境均与长爪沙鼠封闭群的高脂血症密切相关。 Icat基因包括6个外显子,5个内含予,共3683 bp,CDS区长约1337bp,该基因共编码444个氨基酸(KC533867.1),经BLAST比较发现测序的结果与大鼠、小鼠、人、猪和牛lcat基因的CDS区的同源性分别达到了76%、72%、53%及67%以上。大群体PCR-SSCP检测为单态。 利用apoE和lcat抗体对正常、诱发高脂模型和高龄组沙鼠(自发高脂血症)心、肝、肾、脾、肺、肾上腺和脑等器官进行了检测,其中apoE基因在各组织中均有表达。lcat免疫组化结果表明阳性反应仅见于肝、肾、脾、肾上腺组织,在lcat阳性的各种组织中,肾脏的阳性反应最强,高脂饲料诱发组的阳性反应最强。 长爪沙鼠转录组高通量测序结果表明,有效unigene基因47522个(≥100 bp的unigene),大小26.9 Mb,其中长于1000 bp的unigene有8015个。所有详细信息注释上NR、SWISS-PROT、CDD、PFAM和TREMBL库的基因分别有51.43%、49.20%、50.93%、32.65%和44.19%。有693个gene被注释到24种COG分类中,GO注释上的基因共有12914个,注释的酶数为1004个,映射到282个pathway。基因GO分类,主要涉及是信号传导、细胞粘附、细胞凋亡、细胞分化、免疫反应、炎症反应、能量代谢等16个方面(P<0.001)。差异基因富集表明与长爪沙鼠高脂血症有关的基因共3241个,包括32通路(P<0.001),其中与脂,脂代谢,免疫与炎症相关的基因有352个,通路有23个。