猪GBP6基因多态位点扫描及其在杜洛克×二花脸F2群体中的血液性状的关联分析

来源 :宁夏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:roseisdead
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鸟苷酸结合蛋白GBP6是鸟苷三磷酸酶家族成员之一,能够有效促进机体的干扰素(IFN)应答。研究发现,在猪的GBP6基因编码区存在若干SNPs位点,其中一个SNP位点改变了起始密码子,形成GBP6基因的一种选择性剪切转录本。因此,我们猜想这一SNP位点对猪GBP6功能具有潜在影响,可以作为免疫相关性状的功能候选因子。本文分析了猪GBPs基因的SNPs比例以及源于pGBP6的致病错义突变的影响。  本文用限制性内切酶N1 aⅢ在不同猪品种(杜洛克,长白,陆川和东山)中对GBP6基因编码区的一个SNP位点进行基因分型。结果表明,基因型及等位基因频率在不同品种中差别很大。然后在306头F2杜洛克×二花脸资源群体中对22个血液性状进行关联分析。模拟病毒感染处理后测定三个主要部分,11个白细胞性状,6个红细胞性状和5个血小板性状。线性混合模型分析表明,此SNP位点的不同基因型与五个血液性状呈显著相关,包括血小板计数(PLT,P<0.01)、血小板压积(PCT,P<0.01)、白细胞计数(WBC,P<0.01)、中性粒细胞计数(NE,P<0.05)、红细胞计数(RBC,P<0.05)。基因型和表型相关分析表明,纯合基因型和杂合基因型具有不同的表型分布。
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