小麦SNP标记与SSR标记整合高密度遗传图谱的构建

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小麦(Triticum aestivum L.)是世界上重要的粮食作物之一,培育高产、优质、多抗的品种是小麦育种者的共同目标。分子标记辅助选择(MAS)技术的应用,极大地加速了育种进程。而MAS技术需要高密度的遗传图谱才能满足目标性状的准确定位。因此,小麦高密度遗传图谱对于分子育种非常重要。本研究以包含131个家系的重组自交系(F8:9)群体为材料,利用小麦iSelect 90K SNP芯片和SSR标记技术构建了 一张覆盖小麦21条染色体的高密度遗传图谱。该图谱共含有10858个SNP标记和216个SSR标记,其中有2038个非共分离的标记位点,覆盖普通小麦染色体总长度3584.0 cM,标记间平均遗传距离为0.32 cM。进一步分析该图谱发现,A、B、D染色体亚组分别有3741、6091和1242个标记,分别占总标记数的33.8%,55%,11.2%;3个染色体组标记间平均遗传距离分别为0.38cM、0.21cM和0.71 cM。此图谱的偏分离标记所占比例较低,偏分离区域具有成簇分布的特征并且多数偏分离的方向是一致的。该高密度遗传图谱的构建为小麦分子标记辅助选择提供了有力工具。
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