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鳜是我国重要的鱼类养殖品种，而近年来传染性脾肾坏死病毒(Infectious Spleen and Kidney Necrosis Virus，ISKNV)对鳜养殖造成了严重的经济损失。为了研究病毒与宿主的相互作用，本论文应用抑制性消减杂交技术构建了ISKNV感染鳜在发病过程中不同时期的脾脏差异表达基因文库，其中2个正向库Tester分别为在发病初期鳜脾——感染4天，及病重濒死鳜脾——感染11天，各以注射PBS组和康复组为Driver；2个反向库则为Tester和Driver与相应正向库互换。随机挑选阳性克隆进行鉴定、测序及同源性分析，并以半定量RT—PCR进行验证。测序和拼接后获得407个表达序列标签，从中筛选和鉴定了144多个差异表达的基因片段，已递交Genbank登记。这些差异表达的基因片段包括免疫相关的蛋白和酶、信号调节和转导相关因子、凋亡相关、消化和代谢、转录和合成、细胞骨架、核糖体相关和未知功能的EST；其中，成员最多的是免疫相关的蛋白和酶基因类。
NF—кB激活蛋白(NF—кB activating protein，NKAP)经RACE所得的cDNA全长1612 bp，编码432aa、预期大小为50.34 kDa的蛋白，序列比对表明其为一进化上高度保守的蛋白。在ISKNV感染的过程中，鳜NKAP(mfNKAP)在转录水平上有小幅下调。EGFP融合的mfNKAP定位于细胞核，并能引起细胞染色质强烈固缩，激光扫描共聚焦显微镜下清晰可见转染mfNKAP48h的细胞核形成凋亡小体。通过NF—кB双萤光报告系统发现，在转染mfNKAP的293T细胞中，不论是否用TNFα刺激，mfNKAP都能够激活NF—кB的活性，并能增加p50在胞质中的含量。在TFV感染过程中，mfNKAP过表达FHM细胞比对照组相应的细胞病理变化出现时间推迟了8h。显示mfNKAP有一定的抗病毒能力。
鳜VHSV诱导蛋白(mandarin fish VHSV—induce protein—like protein，mfVIP)经RACE所获得的全长cDNA有两个拷贝，短的序列长度为1265bp，长的序列长度为1307 bp，编码155aa、预期大小为17.45 kDa的蛋白。生物信息学分析认为VIP为—含IG—like结构域、膜上有定位的蛋白，并有广泛的细胞亚定位。通过绿色荧光蛋白和间接细胞免疫荧光等方法分析mfVIP的亚细胞定位，并确认了其在细胞膜上有定位。在ISKNV感染的过程中，mfVIP在鳜多种组织里的转录水平上明显增加。回归感染实验中，同时注射pET—mfVIP重组蛋白和ISKNV可加速病鳜死亡；而印片结果显示实验组(I+mf)比ISKNV感染对照组的脾脏肿大细胞少；芯片数据显示I+mf组的免疫球蛋白、趋化因子IL—8、CC chemokine、MIP-1或与细胞因子分泌表达调控相关的蛋白JFC/EBPb、Ikaros、HLA—G以及与蛋白合成降解代谢相关等蛋白基因被上调表达，表明mfVIP在激活宿主免疫系统、刺激细胞因子方面有强烈作用。通过GST pull—down实验推测mfVIP与翻译延伸因子1α相结合。
通过RT-PCR报道了斑马鱼VIP的存在，zfVIP在斑马鱼的脾脏、肠、心脏、性腺中含量较高，鳃中有微弱扩增，肌肉和肝脏中检测不出来；实时荧光PCR显示在胚胎发育0h时zfVIP的就有一定的转录水平存在，1h稍为升高，其后一直下降，到16h后几乎不表达，成鱼后才开始逐步恢复表达，因此认为zfVIP在胚胎中极有可能为母源性因子。ISKNV感染后，zfVIP mRNA在斑马鱼脾脏中含量增加，到第6天为表达最高峰，其后逐步下降。