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稻米品质是水稻重要的育种目标性状，包括外观品质、加工品质、蒸煮品质、营养品质和食味品质等。直链淀粉含量(AC)、糊化温度(GT)和胶稠度(GC)是影响稻米蒸煮食味品质的重要指标，其中Wx基因是控制直链淀粉含量的主效基因，Alk基因是控制糊化温度的主效基因。本研究利用单片段代换系对Wx和Alk基因及其互作对稻米品质的影响进行了研究，获得如下研究结果： 1、利用15个携带不同Wx等位基因与3个携带不同Alk等位基因的单片段代换系进行杂交和分子标记辅助选择，共获得36份双基因聚合系。 2、利用26个携带Wx基因的单片段代换系分析了Wx基因的遗传效应，Wxg3型，Wxg2型，Wxg2型，Wxt型和wx型直链淀粉含量依次降低，分别对应高AC组，较高AC组，中AC组，低AC组和糯性组。 3、利用18个携带Alk基因的单片段代换系分析了Alk基因的遗传效应，将Alk基因分为两种等位基因，即TT型和GC型，其碱消值分别为高和低，TT型早季和晚季的碱消值分别为5.00-6.58和6.38-7.00，GC型分别为2.00-3.08和4.08-5.75。 4、Alk基因对不同Wx等位基因的表达影响不同。不同Alk等位基因对Wxg3型，Wxg2型和wx型的直链淀粉含量无显著影响，但对Wxg1型和Wxt型的直链淀粉含量影响显著。 5、Wx基因对稻米糊化温度影响显著，但不同Wx等位基因对稻米糊化温度的影响不同。wx型与TT型互作能极显著地提高稻米的糊化温度，而Wxg3型、Wxg2型、Wxg1型和Wxt型与TT型互作对稻米的糊化温度无影响；与Wxg3型、Wxg2型和Wxg1型相比，Wxt型或wx型能极显著提高GC型稻米的糊化温度。 6、Wx基因和Alk基因对胶稠度均有显著影响。不同Wx等位基因对胶稠度的影响不同，除Wxg3型外，胶稠度随着直链淀粉含量的提高而降低，即wx型>Wxg3型>Wxt型>Wxg1型>Wxg2型；通过对携带Alk基因的SSSL的胶稠度分析发现，GC型可以显著提高稻米的胶稠度；进一步研究发现，当Wxg2型、Wxg1型和Wxt型与GC型聚合后可以显著提高稻米的胶稠度，而Wx-10G型与GC型聚合后则会显著降低稻米的胶稠度。 7、Wx基因对水稻垩白影响显著，Wxt型SSSL的垩白粒率和垩白度显著低于Wxg3型、Wxg2型和Wxg1型。Alk基因对稻米的垩白粒率有显著影响，但对稻米的垩白度影响不显著。当Wxg3型与TT型聚合后，可以显著降低稻米的垩白粒率和垩白度，Wxg2型与TT型聚合后也可以显著降低垩白粒率，Wxg1型与TT型聚合后，可以增加稻米的垩白度。 本研究进一步明确了Wx和Alk基因的遗传效应及其互作效应，为进一步改良稻米品质、开展水稻品质性状的分子设计育种奠定了基础。