解淀粉芽孢杆菌PEBA20野生株与变异株SCEV转录组分析及cheA基因突变株构建

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chungpy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
解淀粉芽孢杆菌PEBA20是从植物中分离到的内生细菌,对多种植物病原真菌和细菌具有良好生防活性。变异株SCEV是PEBA20在单一环境持续继代培养得到的可稳定遗传的表型变异株,其生物膜表型、运动性特征以及抗菌活性都发生了明显变化。本研究对变异株SCEV和PEBA20野生株进行转录组测序分析,并利用同源重组法构建了△cheA突变株。主要研究结果如下:(1)通过RNA-seq得到大约2.4G数据,WT(野生株)和SCEV中分别有3825和3757个表达基因,共有2339个表达差异基因。通过KEGG富集发现TCA循环路径中存在大量基因表达差异;芽孢形成和休眠调控路径中,SCEV芽孢外壳蛋白和孢子萌发调控蛋白相关基因表达显著下调,启动芽孢形成级联反应的关键调控因子spo0A、kinA、sigD和sigF显著上调;SCEV抗菌化合物合成的非核糖体肽及聚酮类合成路径的基因全部上调;分析与细菌群体感应相关的基因中,22个上调表达基因和12个下调表达基因,趋化性和鞭毛组装调控路径中,SCEV共34个表达差异基因上调。这些基因表达差异,暗示着SCEV在芽孢形成、抗菌活性、运动特征上可能存在差异。(2)测定了WT和SCEV运动性的差异,在0.3%LB平板上测定细菌的趋化运动能力,发现WT的趋化运动能力强于SCEV;在0.7%LB平板上测定细菌的群集运动特征,发现WT表现出明显的群集运动特征,而SCEV几乎不产生群集运动。通过同源重组技术构建了PEBA20的che A基因突变株。通过PCR扩增cheA基因同源前臂、同源后臂和kan抗性基因片段,连接到pMUTIN4自杀载体。通过电转化分别转入PEBA20感受态细胞并通过抗生素筛选获得了cheA基因突变株。△cheA突变株在固气界面不能形成复杂的生物膜表型,生物膜表面平坦、光滑,中部塌陷,边缘略隆起且呈半透明状。在气液界面,△cheA突变株不能形成漂浮生物膜。在0.7%LB和0.3%LB平板上,△cheA突变株丧失了群集运动性和趋化运动性。
其他文献
百日草(Zinnia elegan Jacq.)属于菊科百日草属,是夏秋花卉中优良的一年生草本花卉,具有花期长、花量大、重瓣性强且花色鲜艳绚丽等优点,已广泛应用于国内外的园林绿化。然而,株
按目前规定,维也纳学生每年有假期15周,而家长的假期只有5周。因此,如何安排好孩子们的假期生活,是维也纳市政府的一项重要工作。“非常维也纳”协会负责人萨比纳·克洛纳斯在接
丰花月季新品种‘北京红’是从‘塞维丽娜’ב紫色美地兰’的杂交后代群中选出。花朵朱红色,颜色鲜亮,半重瓣,平均花径7.1 cm,年成花量285朵。生长势强健,抗黑斑病,耐湿热,
当下大部分给截肢者使用的机械手臂在实用性上较局限;它们只有两至三个自由度,只允许使用者每次完成某个单一动作.而且这些机械手臂是通过意识作用来控制的,这意味着使用者在
本刊讯(记者刘雁)前不久,由凯米光学主办、广州亚博光学协办的“眼镜零售业专业培训会”在广州举行。近300名零售商代表参加了培训会。凯米光学市场部总监邴涛主持培训会。凯
草甘膦市场整体呈现疲软状态,价格略有下滑,但仍处于高位。目前草甘膦的需求处于淡季,而市场供应充足,已连续第三个月供应突破4万吨大关,同时由于前段时间价格过高,采购市场
2012年12月31日,江苏苏丝丝绸股份有限公司的苏丝淮安专卖店门前花团锦簇,鞭炮齐鸣,歌声嘹亮,到处一派喜气洋洋的节日景象。苏丝淮安专卖店盛大开业了。江苏省淮安市是中国人
使用不育昆虫释放技术是一项新兴的苹果蠹蛾Cydia pomonella(L.)防治方法,使用转基因得到不育雄蛾具有比传统辐射方法更多的优点。转基因技术通过使用基于piggyBac等转座子的
音乐与文学历来都是相辅相成的。源自于西洋古典音乐中的键盘乐器钢琴,作为一种通过键盘对音乐进行演绎的艺术表现工具,以其宽广的音域、美妙动听的音色和极强的表现力、感染力
由诸种媒介相互依存建构出的媒介产业,需要围绕符合具体媒介特质、符合资源最佳整合需要、符合受众接受习惯与需求的内容信息的生产,在新的产业环境中,找到自己的定位以求发