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用RAPD技术分析了采自我国13个省份、分属于8个不同植物区系区域的53个香菇菌株的遗传多样性。用10个随机引物共扩增出147条RAPD谱带。供试菌株在RAPD带型及DNA相似性上的差异表明，中国香菇自然群体具有相当丰富的遗传多样性，其中，横断山脉、云南高原、台湾及华南地区菌株的多样性尤为丰富。用平均连锁聚类法构建了遗传相关聚类图。以0.658的相似性为切割点，53个菌株可分为4大类群。类群Ⅰ和类群Ⅱ主要由横断山脉、云南高原和华中地区的菌株组成。类群Ⅲ包括了其余地区的菌株。类群Ⅳ则是由华北及四川省某些菌株组成的一个小分支。在0.750的相似性上，这4大类群可进一步分成20个RAPD指纹相似组(RGs)。其中，16个指纹相似组与菌株的地理来源呈明显相关，其余4个指纹相似组则属于广泛分布的类型。