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水稻细菌性条斑病(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)是水稻上危害最严重的病害之一，严重制约华南地区水稻的生产。利用抗病品种是控制该病最经济、最有效的措施。本研究通过基于金刚30、IRBB4、IR24、IRBB21、IRBB14和IRBB5为鉴别品种的致病型划分方法，以及基于PCR的分子指纹分析法，从致病型和分子谱型2个方面对华南地区广东、广西、福建和海南4省区的菌株进行了研究，同时利用不同致病力菌株对水稻品种的抗病性评价。主要研究结果如下：
1.华南地区水稻细菌性条斑病菌致病力分化研究
以金刚30、IRBB4、IR24、IRBB21、IRBB14和IRBB5为等6个品种为鉴别品种，采用孕穗期针刺接种的方法，以病斑长度为依据，将来自广东、广西、福建、海南的159个条斑病菌株划分为O、I、II、III、Ⅳ和V等6个致病型，各致病型在鉴别品种上的反应依次为RRRRRR、SRRRRR、SSRRRR、SRSRRR、SSSRRR和SSRSRR，出现频率为8.18％、79.25％、5.03％、5.03％、1.87％和0.63％。总群体的多样性指数为0.36，I型是华南稻区的优势致病型。
来自广东、广西、福建和海南的菌株分别分别被鉴定出6、2、5和3个致病型，致病型多样性指数分别为0.37、0.09、0.53和0.44。4个省（区）的优势致病型都是I型，频率分别为78.79％、95.65％、68.00％和75.00％。
2.华南地区水稻细菌性条斑病菌遗传结构研究
采用基于PCR指纹技术对华南地区的179个水稻细菌性条斑病菌菌株的DNA指纹图谱及进行了分析，以明确华南地区水稻细菌性条斑病菌的群体遗传结构。结果表明，华南地区水稻细菌性条斑病菌的群体结构具有较丰富的遗传多样性，在73％的指纹相似性水平上可将179个菌株划分为11个不同的簇群，总群体多样性指数为0.83，簇D为华南地区的优势簇。
来自广东、广西、福建和海南的菌株分别鉴定出8、6、3和4个簇，多样性指数分别为0.83、0.74、0.42和0.66。4个省区的优势簇群分别是C、D、D和E簇，频率分别为18.71％、44.74％、75.00％和45.00％。
相关性分析表明指纹分析的遗传系谱与致病型存在复杂的关系。
3.华南地区部分主栽品种（后备品种）抗性鉴定
采用孕穗期针刺接种的方法，以病斑长度判断各品种的抗病性。测定了华南地区82个水稻主栽品种（包括后备品种）对水稻细菌性条斑病菌的抗性。其中大部分水稻品种对强毒力菌株表现感病，对弱毒力菌株表现抗病。籼型常规稻比籼型杂交稻抗病。没有发现免疫品种，宏优673、粤香占和特籼占13表现出很好的抗性。