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科研经费使用混乱,违规现象丛生,是全国高校普遍存在的问题。良好的科研经费内部控制建设,对降低科研经费管理风险有着重大意义,这关系到我国科研领域的长远健康发展。高校属于公益性事业单位,其管理自然更加注重社会效益,而非经济效益。因此,大部分高校对内部控制的内容、实质和建设意义缺乏主动探索的意识。随着高校“产学研”合作的深入推进,高校通过与企事业单位合作取得的横向科研经费总量也越来越大,横向科研项目资金的管理不容忽视。但由于横向科研项目合同协商的金额具有不确定性,资金的使用更具有自主性,现实中大部分高校忽视横向科研项目资金管理的重要性和迫切性,将横、纵项科研项目资金管理一概而论,这是造成横向科研经费管理混乱的主要原因。为规范科研经费管理,2016年7月发布的《关于进一步完善中央财政资金管理等政策的若干意见》要求,通过改革和创新科研经费使用和管理方式,更好地适应科研活动规律和特点,为科研人员创造良好的制度环境。而在行政事业单位内控改革方面,2015年12月财政部印发了《财政部关于全面推进行政事业单位内部控制建设的指导意见》(财会[2015]24号)提出全面推进行政事业单位内部控制建设的总体目标,以规范单位经济和业务活动运行为主线,要求到2020年基本完成内部控制建设。因此,高校作为行政事业单位,其横向科研项目资金内部控制建设不仅响应了外部政策号召,也是提升高校治理水平的内在动因。本课题详细解读了我国2014年1月1日推行的《行政事业单位内部控制规范(试行)》、《教育部直属高校经济活动内部控制》[2016]2号、《教育部关于进一步加强高校科研项目管理的意见》[2012]14号等高校科研经费管理和行政事业单位内控建设相关法律法规和管理办法,结合行政事业单位内部控制理论、委托—代理理论、预算管理理论,联系国家大力推动科技创新,改革科研资金管理的大环境,以D高校的横向科研项目资金管理现状为研究对象,通过分析其制度和实际业务执行、访谈学校相关人员、检查相关文件记录等方法,探究科研经费管理过程中的内控问题,以及未发现问题但内控风险较高的事项,挖掘问题产生的原因。本文创新地依照行政事业单位内部控制理论中的对内控要素的分类,从组织架构、制度层面、业务层面、绩效评价、信息系统和监督机制六个方面建立了高校横向科研项目资金内部控制体系,将横向科研项目资金的业务进行风险点梳理,重新规划业务流程,作为科研项目资金管理日常业务运行的参考,对财务人员,科研人员,行政人员进行有机结合。明确各部门各岗位的职责分工和业务范围,将责任落实到人,对实务有着切实的应用意义,这在高校科研项目资金管理研究方面是少有的。本文构建D高校横向科研项目资金内部控制体系,对其他无论是高校还是科研单位的横向课题经费管理同样具有参考价值。