【摘 要】
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目的:通过基因芯片技术和生物信息学方法筛查及分析食管鳞癌中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)及mRNA的差异表达谱,以及这些差异lncRNAs的功能、互作分子。方法:1.
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目的:通过基因芯片技术和生物信息学方法筛查及分析食管鳞癌中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)及mRNA的差异表达谱,以及这些差异lncRNAs的功能、互作分子。方法:1.收集并随机选取三对食管鳞癌患者肿瘤组织及癌旁组织,对组织进行分离和提取总RNA。2.通过OE-Biotech Human LncRNA芯片V2.0,检测食管鳞癌的lncRNAs和mRNAs表达谱,以差异倍数大于等于2.0且P值≤0.05为标准,筛选出癌和癌旁组织存在差异表达的lncRNAs和mRNAs。3.对差异表达基因进行生物学聚类分析;预测这些差异表达的lncRNAs潜在靶点、通路,及其与临近编码基因、转录因子的相关性。4.对筛选出来的差异表达的lncRNAs行qRT-PCR检测,验证其在组织中的表达情况。结果:按FC值≥2.0且P值≤0.05的标准,共筛选得到癌及癌旁组织差异表达的l ncRNAs182个,mRNAs108个,GO聚类和Pathway富集分析发现差异lncRNA s潜在靶标基因与细胞周期调控、细胞分化、细胞外基质等活性密切相关,进一步生物分析得到lncRNA NONHSAT015779、NONHSAT08197、NONHSAT112918和NONHSAT115190等17个lncRNAs可能与食管鳞癌发生发展密切相关。结论:与癌旁组织相比,lncRNAs在食管鳞癌组织中显示不同的表达模式,这些差异表达的lncRNAs可能在食管鳞癌的发生和发展发挥着重要作用。
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