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癌症是21世纪威胁人类健康的三大杀手之一。而转移性肾细胞癌和恶性黑色素瘤因是目前医学界较难攻克的恶性肿瘤。研究发现细胞因子IL-2可以通过促进T细胞和NK细胞的增殖分化激活来发挥其免疫应答效应,进而对恶性肿瘤产生杀伤作用。但因其在治疗中存在的诸多“短板”,如半衰期长、可引起血管损伤征等,使得寻找一种替代IL-2R的高效低毒的制剂迫在眉睫。本文利用计算机辅助药物设计方法成功构建出人类IL-2野生型、突变体与其受体的4个复合物体系,而后利用分子动力学模拟的方法对IL-2野生型、突变体与其受体的作用机制进行了相关探究,得到了IL-2野生型和突变体与其受体结合的关键氨基酸残基并发现IL-2主要是通过与IL-2Rβ结合发挥生物活性的。再利用分子对接技术对IL-2受体进行了包含1132个小分子的化合物库的虚拟筛选,挑选出打分最好的前1%的结果进行相互作用分析,得到了3个候选化合物结构。上述研究成果对更好地理解IL-2与其受体的识别和作用机制提供了一些帮助,为小分子类制剂设计的可行性分析以及IL-2突变体的设计提供一定的参考。本文另一独立部分是关于Orexin体系的分子机制以及Orenxin受体抑制剂的研究。由于现代社会生活节奏快、压力大,越来越多的人存在失眠的状况。研究表明,存在于中枢系统内的Orexin受体与其内源性多肽激动剂作用,控制生物的睡眠-觉醒状态调节。因此作为G蛋白偶联受体家族的成员——Orexin受体已成为治疗失眠的新靶点。首先我们利用计算机辅助药物设计的相关技术构建出了Orexin与其受体的复合物模型,并对Orexin受体与其内源性配体Orexin进行了作用机制的研究,得到了Orexin与其受体结合的关键氨基酸残基。同时,将两个Orexin受体分别与文献检索得到的10个Orexin受体抑制剂进行了分子对接,并提取每个对接结果中打分最优的构象进行相互作用分析并据此,构建出了包含1个疏水特征、1个芳香特征和2个氢键受体特征的Orexin受体抑制剂模型。上述实验结果在目前尚无Orexin及其受体的复合物结晶情况下,这为该体系作用机制的研究以及后续Orexin受体小分子类抑制剂的设计和优化提供一定的参考。