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北部湾盆地涠西南凹陷是第三纪大陆边缘断裂凹陷，凹陷演化经历了三次张裂和裂后沉降。
早第三纪古新世北部湾盆地进入初始裂陷阶段，在近北西-南东向拉张应力作用下发育起了控盆的一级断层-涠西南断层，控制了长流组沉积，堆积了红色砂砾岩、泥岩互层为主的洪、冲积相地层。
始新世第二次张裂期，构造应力发生顺时针方向的旋转，在近北北西-南南东向的拉张应力作用下，产生了走向北东东-南西西具有控凹作用的①号断层，伸展作用横向上表现出明显的非均衡性，沉降中心位于断层中段下降盘，控制了烃源岩流沙港组的沉积，这一时期整个北部拗陷为一统一的湖盆，经历了由扩张、鼎盛到萎缩的过程，在凹陷的东南部，下降盘断块翘倾，流沙港组超覆在企西隆起之上。
中晚渐新世进入第三次张裂期，构造应力继续发生顺时针方向的旋转，在近南-北向的拉张应力的作用下，产生了走向近东-西起控带作用的②号断层，同样其横向上也表现出明显的非均衡性，沉降中心位于凹陷东部-②号断层下降盘涠6-9～涠12-1构造附近，控制了裂陷晚期涠洲组沉积，并将始新世形成的统一湖盆烃源岩体分割开来，同时西南部③号断层在渐新世末的强烈活动，使②号断裂带下降盘的烃源岩体成烃演化出现“东西分异”及③号断裂带把北部拗陷分割为涠西南凹陷和海中凹陷的格局。
到晚第三纪，涠西南凹陷区进入裂后热沉降阶段，整体下沉接受晚第三纪和第四纪海相沉积。
根据地层沉积特征、断裂结构和油气成藏条件，将涠西南凹陷大致划分为四个构造单元：北部1号断裂陡坡及潜山构造带、中部2号断裂带、西南部构造斜坡带及东-东南部沉积斜坡带
受中晚渐新世构造幕断裂活动的影响，涠西南凹陷现今烃源岩分布与沉积时有较大的变化：3号断层的强裂活动把北部拗陷分割为涠西南凹陷和海中凹陷，而位于3号断层上升盘的涠西南西南部抬升遭受强烈剥蚀，流沙港地层被剥蚀饴尽；2号断层和3号断层东段的活动将涠西南凹陷统一的烃源岩体分割成现今的A、B、C三个次一级生油洼陷，由于后期构造演化及埋藏史存在差异，三个次级生油洼陷在成烃演化上存在东西分异。
根据H/C-O/C、Ih-Tmax、干酪根镜检分类特征分析，流一、流三段为Ⅱ1-Ⅱ2型，以生油为主、也可生气，流二段为Ⅰ-Ⅱ2型，生油为主。
流沙港组生油岩的生油窗为2400～3900m，埋深大于3900m时进入纯生气窗、涠西南凹陷钻井揭示主要储层有石炭系灰岩、始新统流沙港组砂岩、渐新统涠洲组砂岩和上第三系下洋组、角尾组海相砂岩。由老到新三个构造层发育六套主要储盖组合，分别是：以石炭系灰岩为储层，长流组或流沙港组为盖层的储盖组合一；以流三段砂岩为储层，流三段上部或流二段泥岩为盖层的储盖组合二；以流二段砂岩为储层，流二段泥岩为盖层的储盖组合三；以流一段中下部砂岩为储层，流一段上部泥岩为盖层的储盖组合四；以涠四段、涠三段砂岩为储层，涠三段或涠二段泥岩为盖层的储盖组合五；以角尾组或下洋组上部砂岩为储层，角尾组上部泥岩为盖层的储盖组合六。
本文在含油气系统概念、方法、理论体系指导下，从有利于指导生产实际出发，考虑到与盆地内其它凹陷今后含油气系统研究的统一性，将涠西南凹陷作为一个含油气系统。同时，密切结合涠西南凹陷早第三纪断陷、晚第三纪坳陷的构造演化及②、③号断层活动对烃源岩体的分割造成烃演化差异等因素，将涠西南凹陷含油气系统进一步细划，建立了如下确定含油气子系统边界的原则：
①以分割烃源岩体及可作为油气运移通道体系的控盆、控凹、控带断裂为界；②以地层超覆线、岩性尖灭线为界；③以分隔油气运移通道体系的凸起及凹陷的轴线为界。
在上述原则、细节指导下，通过深入细致地对比解释、分析了凹陷内大量二维、三维地震剖面、钻井资料等，基本摸清了凹陷的结构、构造、沉积特征等后进行子系统的划分与分析。
以烃源岩体的展布为依托，结合平面上构造特征的分析，本着使每个子系统都有近似的构造演化特征、统一的烃源岩及时空分布范围，将涠西南凹陷划分为3个含油气子系统，并以早第三纪断陷阶段构造特征为主来命名，这些子系统是：
A子系统——①号断裂带-古潜山-披覆构造含油气子系统；B子系统——B洼陷深陷-沉积斜坡含油气子系统；C子系统——西南部构造斜坡-披覆构造含油气子系统。
在对各子系统进行从成藏条件及成藏动力学演化过程分析后指出了各子系统有利勘探区带。从成藏条件及已发现的油气藏展布来看，B子系统是最有利的子系统，A子系统次之，C子系统更次。建议集中力量在B、A两个子系统内的有利区带进行深入研究。