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近年来,我国对于航天科研事业持续关注,不断加大国防科研财政资金的投入力度与比例,并在各重点领域出台举措大力推进航天事业的飞速发展。同时,随着航天科技成果转化应用于国民经济建设理念的不断深入,航天科研事业单位在承担军工科研试验任务的同时,更加注重军民品融合业务的培育与发展,着力提升民用产业市场的开发力度,增强市场综合竞争能力与可持续发展能力。因此,加强航天科研事业单位内部审计,完善内部审计机制体制建设,提高内部审计工作质量,对规范国防科研财政资金使用,防范舞弊行为,保障国家财政资金安全及实现航天科研事业寓军于民等凸显重要。本文选取北京航天发射技术研究所(以下简称“航天发射所”)这一航天科研事业单位为切入点,以航天发射所内部审计为研究对象,依据航天发射所独具的科研事业单位管理体制与企业管理模式相融合的特殊性,在国内外内部控制和内部审计研究现状的基础上,结合航天科研事业单位管理体制、运作模式、财务核算方式等特点,介绍了航天发射所内部审计机构设置、工作流程及近年内部审计项目开展现状,对航天科研事业单位内部审计特征进行了系统分析,并归纳出航天发射所现阶段内部审计发现的问题与制约内部审计职能有效发挥的瓶颈。通过分类归纳与统计,梳理了航天发射所内部审计机构在实施领导干部离任经济责任审计项目、财务审计项目、全面预算审计项目、资产状况审计项目及建设项目竣工财务决算审计项目等内部审计项目中发现的审计问题,并针对航天发射所内部审计自身存在的机制体制不完善、目标定位不准确、人员结构不合理等方面的问题进行深入分析,从而提出了内部审计目标合理定位、建立健全内部审计制度、加强内部审计独立性、扩宽内部审计领域、改进内部审计方法、加强事前事中审计、提升审计队伍建设、强化内审结果追踪与利用等具体改进建议,以实现航天发射所内部审计职能的有效发挥与内部审计监督高效运行。希望本文能够为当前航天科研事业单位普遍存在的共性问题提出有效解决方案,为同类型事业单位的内部审计改革与转型提供借鉴与参考,为我国航天科研事业单位内部审计发展提供现实依据。