m6A调控细胞周期的分子机制研究

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m6A(N6-methyladenosine)修饰是广泛存在于RNA上的一种甲基化修饰形式,能够影响mRNA的加工代谢,包括剪接、出核、翻译、降解及稳定性,为基因表达调控研究提供了新的思路。细胞有丝分裂的有序进行是生物体正常生长发育的基础,m6A甲基转移酶的表达异常能引起细胞有丝分裂的紊乱,然而m6A修饰与细胞有丝分裂调控之间的关系尚不清楚。  本课题利用Thymidine(胸苷)双阻断法实现HeLa细胞周期的同步化,并在去除药物后释放不同时间获得各个时期的细胞样品,通过RNA-Seq、MeRIP-Seq等技术来检测细胞周期各时期m6A修饰水平、m6A修饰图谱特征、各时期m6A修饰基因的表达,探究m6A修饰基因在不同时期的表达差异,进而研究m6A修饰对细胞周期进程的调控作用。结果表明,细胞周期的不同时期存在m6A修饰水平的差异性,在G2/M期细胞中RNA m6A修饰水平显著升高。随后,我们分析了细胞周期不同时期的m6A修饰图谱,发现m6A修饰主要分布在mRNA编码区和3UTR区域,且在终止密码子附近显著聚集。通过统计并分析各时期发生m6A修饰的基因,我们发现G2/M期m6A修饰基因的功能大多富集在细胞周期相关通路上。通过分析相邻时期表达下调并存在m6A修饰的基因,发现其中相当一部分与细胞周期网络相关,且这些基因之间存在一定程度的相互作用,从中找到了细胞周期时期转变过程中的关键基因。综上,m6A修饰可能通过调控细胞周期相关基因的降解促进细胞周期进程。此外,我们还发现RNA不同修饰形式m6A和m5C之间存在相互作用,进一步推测不同的RNA修饰可能共同调控着细胞周期进程。
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