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肌肉的生长发育主要是由一系列的相关蛋白编码基因来调控的,而miRNA作为关键的转录后调控因子,参与了编码基因的调控过程。为了明确这些因子随着年龄增长的变化情况,以猪为研究对象,在对6个看家基因进行稳定性评估后,利用五个时间点的心肌、背最长肌及腰大肌组织,以荧光定量的方式测定了与肌肉生长发育相关的25个蛋白质编码基因和16个miRNA的表达量,并利用STEM软件对目的1mRNA和miRNA表达模式进行聚类。得到如下结果：1.利用NormFinder和GeNorm软件对看家基因PPIA, ACTB, TBP, Top2B, YWHAZ, RPL4进行稳定性评估,选取PPIA, YWHAZ和RPL4作为本次试验的内参基因。2.利用STEM软件对编码基因聚类发现：在心肌中,MSTN, NFκB, Smas2, Smad3, S6K1, PDK1, IGF1R, Akt1极显著地聚为一类(P< 0.001); MURF1, Follistatin, MAPK显著地聚为一类。在背最长肌中,MTOR, FOXO1, MRF4, IGF1, MURF1, Smad3, MYHC, SRF, MEF2A, Akt1和IRS1极显著地聚为一类(P< 0.001); Smad2, MYF4, MYOD, Follistatin, MYF5, IGF1R极显著地聚为一类(P=0.009)。在腰大肌中,NFκB, FOXO1, MRF4, IGF1, MURF1, PDK1, GSK3极显著地聚为一类(P= 0.002); Smad2, MYF4, Follistatin, MYF5, PI3K显著地聚为一类(P=0.02)。3. miRNA聚类结果显示：在心肌中,miR-1, miR-486, miR-221, miR-195, miR-320, miR-24极显著地聚为一类(P<0.001)；miR-214, miR-181c, miR-181a, miR-499显著地聚为一类(P=0.040)。在背最长肌中miR-1, miR-133a-5p, miR-214, miR-221-3p, miR-499-5p和miR-320极显著地聚为一类(P<0.001)。腰大肌中,miR-1,miR-208b, miR-206miR-486和miR-499极显著地聚为一类(P=0.003)。4.显著性检验和相关性分析发现,IGF1-miR-1等57对mRNA-miRNA在试验五个时间点,都表现为显著的负相关。以上结果证明了多种蛋白编码基因和miRNA参与了调控横纹肌的生长发育进程,且各自展现出特异的表达模式,为进一步研究肌肉生长发育机制奠定基础。