基于RNA-seq测序分析酸雨对大豆苗期生长发育的影响

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近年来,酸雨、臭氧层空洞和全球变暖问题是全球主要的环境问题。酸雨是严重威胁世界环境的重大问题之一。大豆是一种主要的油料和产蛋白作物,大豆的产量问题是大豆育种时首先要考虑的问题,酸雨对大豆的生长发育和产量有重要的影响。本试验通过RNA-seq测序,来研究大豆生长发育过程中对酸雨胁迫的响应机制,本次试验中通过模拟酸雨在大豆苗期五个生长阶段进行处理并取样,构建cDNA表达文库,在五个阶段中共找到表达基因73,320个,差异表达基因2,016个,其中与酸雨胁迫响应密切相关的基因有385个。研究发现,在模拟酸雨胁迫条件下,大豆的光合作用相关的光反应I、光反应II和光合电子传递相关基因表达均受到明显抑制作用,大多数与碳代谢相关基因表现下调,在氮代谢和硫代谢途径中,很多与谷胱甘肽合成相关基因均表现为上调趋势,与谷胱甘肽降解相关酶均受到抑制,在活性氧途径中,所有与活性氧降解相关的超氧化物歧化酶、过氧化氢酶、过氧化物酶、单脱水抗坏血酸还原酶、氧化还原酶、抗坏血酸过氧化物酶、半胱氨酸过氧化物氧化还原酶、硫氧还蛋白和谷胱甘肽过氧化物酶合成基因表达均受到明显的促进作用,其中谷胱甘肽和活性氧降解途径中的多种酶编码基因,与植物抗非生物胁迫密切相关。本次研究全面深入的探索了酸雨胁迫对大豆苗期生长发育产生影响的基因及其作用机制,找到了大豆抗酸雨胁迫相关的关键基因,为大豆抗酸雨胁迫育种奠定理论基础。
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