中国汉族先天性单侧肾缺如患者候选基因致病突变筛查

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Sophie_LGH
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背景:既往少有研究聚焦先天性单侧肾缺如这一独特表型。该表型患者通常临床表现隐匿,但随着病情进展,高血压、蛋白尿等症状均可能出现,部分患者甚至发展为终末期肾脏病。目的:在大组中国汉族先天性单侧肾缺如患者队列中,针对根据文献确定的大组候选基因进行致病突变筛查,明确突变谱。方法:通过文献阅读,并参考基因、蛋白质公共数据库信息,确定候选基因。根据病史及影像学资料,纳入2008年1月至2016年1月在上海交通大学医学院附属瑞金医院肾脏科诊治的中国汉族先天性单侧肾缺如患者。因肾脏切除所致孤立肾及继发因素所致萎缩肾个体均予以排除。同时纳入100例汉族健康正常人作为对照。针对候选基因的所有编码区及邻近内含子区进行目标区域二代测序,所有突变位点均经Sanger测序排除假阳性结果,并在100例健康对照中验证。结果:本研究共入选报道在肾脏异常发育患者中存在突变的基因或其相关基因25个,所有候选基因均在肾脏发生过程中起到重要作用,绝大多数存在相互作用关系。该25个基因的遗传模式涵盖常染色体显性,常染色体隐性和伴X遗传。本研究共纳入86例无血缘关系中国汉族先天性单侧肾缺如患者,平均诊断年龄为32岁。9例(10.5%)患者具有肾脏异常发育家族史,15例(17.4%)患者合并泌尿生殖系统其他畸形。本研究在SALL1,EYA1,RET,HNF1B,DSTYK,WNT4以及SIX5这7个基因中筛查出10种致病突变(9种错义突变,1种缺失突变)。所有突变在公共数据库中频率均小于0.1%且均未在100例正常对照中出现,其中8种突变在我们所知的数据库(The Human Gene Mutation Database,1000 Genomes project,Exome Sequencing project,Exome Aggregation Consortium)中没有记录,认为是新突变。保守性分析结果提示绝大多数突变位点从灵长类到斑马鱼都高度保守。部分位点位于重要结构域,与既往报道过的致病性突变位点邻近或位于同一结构域。共9例(10.5%)患者携带候选基因突变。7例患者携带单个杂合突变,其中2例携带DSTYK基因的同一突变c.1532A>G。另外1例患者在RET基因上携带2种不同突变,1例在HNF1B及EYA1两个基因上各携带一种突变。结论:本研究在候选基因中共发现10种致病突变,其中8种为新突变,可解释10.5%中国汉族先天性单侧肾缺如患者的发病原因。突变谱呈分散分布,未发现热点突变。
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