【摘 要】
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该文借助于格子模型和计算机模拟对蛋白质折叠问题进行了系统的研究.多肽链被简化为格子上行走的自避链,其能量则为组成肽链的氨基酸残基之间相互作用的总和.该文选用三个由3
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该文借助于格子模型和计算机模拟对蛋白质折叠问题进行了系统的研究.多肽链被简化为格子上行走的自避链,其能量则为组成肽链的氨基酸残基之间相互作用的总和.该文选用三个由36个氨基酸残基组成,以一种全或无的二态方式折叠的序列,对其折叠机理进行的深入的研究.研究发现,每个序列的转变态构象包含一个相同的部分折叠的核,核所包含的氨基酸残基数为总数的1/4左右,核内接触既有序列上邻近的残基之间形成的接触,也有序列上相距较远的残基之间形成的接触.核的形成是折叠反应的限速步骤,核形成后折叠即呈下山式快速进行.核内接触的形成并没有固的先后次序,一般是近程接触先形成,而远程接触稍后形成,但核只有在转变态才完全形成,随后核的稳定和其余接触的形成同步进行.该文的研究给Fersht提出的蛋白质折叠的成核塌缩机理提供了有力的支持.将实验中常用的蛋白质工程方法用于格子模型模拟中,与直接方法得到的结果进行验证,结果表明这一方法在模拟中同样有效,但同时有一些问题需要注意,特别在突变的选择上要慎重.最后,用基附壁链模型研究了活体蛋白在空间限制条件下的折叠,结果表明,空间限制对折叠转变温度和折叠的协同性会有一定的影响.影响程度随序列而异,但二态折叠这一基本方法并没有受到影响.
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