我国东北地区冻土及黑土土壤中微生物的分离培养及分类学研究

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我国东北松嫩平原土地资源丰富,该地区的黑土地是世界三大黑土区之一,是我国粮食安全的重要保障;同时,冻土和黑土孕育和保存了该地区富有特色的微生物多样性。然而,近年来东北地区生态退化、黑土流失等环境问题极为严重,对黑土地资源的保护和冻土微生物的研究,成为认知该地区在全球气候变化过程中生态退化机理的重要途径,也是认知和发掘该地区微生物资源的重要内容。  黑龙江省绥棱县位于东北地区小兴安岭南端,处于我国冻土带的南边界处,采用直接构建土壤样品16SrRNA基因文库、序列分析等方法对绥棱黑土样品进行细菌多样性分析的结果表明,黑土样品中细菌多样性非常丰富,共检测到13个门级分类单元的细菌,其中的优势菌群为酸杆菌门(Acidobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia),所占比例分别为20.6%、22.8%、20.6%、13.2%。同时,采用本实验室改良的V3M/Gellangum培养基分离培养并进行细菌多样性研究,分离得到100个培养物,其中,变形菌门占31%,放线菌门占51%,厚壁菌门占12%,拟杆菌门占6%。  菌株C3T分离自黑龙江省漠河县北极村的冻土样品。基于16SrRNA基因序列比较及系统发育分析、生长表型特征和生理生化特性、以及细胞极性脂组分、醌、多胺、脂肪酸等研究结果表明,菌株C3T为Undibacterium属的一个新种,定名为Undibacterium terreum模式菌株为C3T=CGMCC1.10998T=NBRC108789T。  菌株Hn和46D均分离自黑龙江省绥棱县的黑土土壤样品。基于16SrRNA基因序列比较及系统发育分析、生长表型特征和生理生化特性、以及醌、脂肪酸等研究结果表明,菌株Hn和46D均属于Mucilaginibacter属;菌株Hn代表该属的一个新种,建议命名为黄色产粘杆菌,模式菌株是菌株Hn=CGMCC1.10996=NBRC108788;菌株46D=CGMCC1.10991=NBRC108786,初步鉴定为该属的另外一个新种,建议命名为粉色产粘杆菌,但最终还需DNA-DNA杂交予以确定。
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