盐芥冷响应miRNA表达模式分析及tsa-miR396功能初探

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yuhuiru871124
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
microRNA (miRNA)是一类不编码蛋白质、长度约为20-24nt的内源单链RNA分子,是广泛存在于动物、植物和微生物等多种有机体中的非蛋白质的基因表达调控因子。植物miRNA的调控作用不仅涉及植物组织器官的生长发育、激素调节、免疫反应等生物学过程,并且参与植物对多种生物和非生物胁迫(如营养胁迫、干旱胁迫、盐胁迫、低温胁迫等)的响应。盐芥(Thellungiella salsuginea)是与模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)亲缘关系非常近的一种盐生模式植物。盐芥在受到冷胁迫后体内缺乏内生冰核因而具有抗寒性,未经冷驯化的盐芥可以在-13℃的条件下生存,冷驯化后的盐芥能够在-18.5℃的条件下生存。本研究分析了盐芥受到冷胁迫后体内部分保守的miRNA表达量变化情况,并对tsa-miR396的功能进行初探。(1)利用实时荧光定量PCR方法检测的结果表明,盐芥受到4℃冷胁迫处理0、2、5、8、12、24小时后,9个miRNA家族(tsa-MIR160、tsa-MIR167、tsa-MIR169、 tsa-MIR171、tsa-MIR172、tsa-MIR319、tsa-MIR396、tsa-MIR403、tsa-MIR408)成员的表达量均存在着不同程度的变化。tsa-miR160abc、tsa-miR171a和tsa-miR171bcde在受到冷胁迫后表达趋势是在5h时下调,8h时上调,12至24h时下调;tsa-miRl67abc、 tsa-miR169a、tsa-miRl69bc、tsa-miRl69deg、tsa-miR172abc、tsa-miR319a、tsa-miR319b和tsa-miR408的表达量在盐芥受到冷胁迫处理后下降;tsa-miR169f的表达量在盐芥受到冷胁迫处理8h后上升;tsa-miR396和tsa-miR403的表达量在盐芥受到冷胁迫后首先分别在2h及5h时上升,接着在8h时下降。(2)由于miRNA的生物学功能主要取决于其靶基因的功能,因此我们利用在线靶基因预测软件psRNATarget预测冷胁迫后响应最为迅速的tsa-miR396的靶基因,结果得到25个靶基因。然后利用5’ RACE (rapid amplification of cDNA ends)方法验证tsa-miR396的靶基因Thhalv10024915m,发现tsa-miR396对于靶基因Thhalvl0024915m的切割位点分别在tsa-miR3965’末端的第8个和第9个核苷酸之间、第10个和第11个核苷酸之间的位置,并且tsa-miR396对靶基因Thhalv10024915m的作用位点位于编码区。(3)最后我们对tsa-miR396前体进行克隆,构建tsa-miR396前体过表达载体,为后续转化做准备,通过对过表达tsa-miR396的转基因盐芥进行耐冷性功能分析,以期为进一步全面、深入的探索盐芥miRNA应答冷胁迫的分子机制提供基础资料。
其他文献
伸缩装置作为公路桥梁结构的重要组成部分,具有传递车辆荷载、调节桥面变形、保证行车通畅等功能,但桥梁伸缩装置的锚固区域容易产生疲劳损坏。采用钢箱-混凝土组合结构设计的装配式桥梁伸缩装置,和传统伸缩装置对比,具有快速安装、易更换等优点,因此对该类型伸缩装置的受力规律、疲劳性能、箱体厚度设计的研究具有重要的工程实践意义。根据装配式桥梁伸缩装置的受力特点、结构特点和施工工艺,制定现场试验时伸缩装置上的测点
学位
第一部分中国江苏地区间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合症患者现状调查目的:了解江苏地区泌尿外科间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合症(Interstitial Cystitis/Bladder Pain Syndrome,IC/B
黄瓜(Cucumis sativus L.)是我国第一大设施蔬菜,种植面积和产量居世界首位。设施生产中黄瓜白粉病[Sphaerotheca fuliginea(Schlecht)Poll.]等危害严重,严重影响黄瓜产量、品质
木聚糖酶是一类重要的半纤维素降解酶,可以将木聚糖降解成不同长度的木寡糖,并在其他侧链水解酶和糖苷酶的共同作用下彻底降解为木糖。具有耐碱和耐盐特性的木聚糖酶可以应用
非线性光学特性是近年来激光物理和量子光学等学科中的热门交叉研究方向,也是国际上光学学术界的前沿研究领域之一,人们对它的研究探讨可以促进量子光学等学科的发展。对于光
IR公司作为空压机行业的领军企业,其在140多年前便生产出了世界上第一批空压机设备。IR公司在中国经过了多年的发展,也形成了完善的渠道网络,产品销量名列前茅。而随着近几年
混沌检测技术引发了微弱信号检测领域的研究热潮,是目前比较先进的科学技术之一。自从1990年混沌系统的检测方法提出以来,诸多国内外学者在这一方面进行了研究并且提出许多基
随着科学技术和实验手段的发展,多学科理论和技术逐渐成为科学领域的前沿课题,特别是对生物膜的研究逐渐成为细胞生物学、生物物理学、分子生物学以及生物医学最活跃的领域之
三波混频过程(TWM)是非线性光学中的一个基础内容。在无衰减泵浦近似下的物理过程与光和二能级原子系统相互作用的物理模型相类似。一般形式的三波耦合过程可用经典的哈密顿
耦合非线性系统可以表现出丰富的集体行为。耦合群体中集体行为的出现机制是非线性动力学研究的一个基本问题。在对全局耦合非线性系统的研究中,例如,Kuramoto相振子模型和Ka