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青光眼是世界上第二大致盲眼病，也是我国当前重要的盲眼病之一。国内原发性青光眼按照其发病时房角结构的变化可分为两种类型，原发性开角型青光眼(primary open angle glaucoma, POAG)和原发性闭角型青光眼(primary angle closure glaucoma，PACG)。到目前为止已经有研究发现与原发性开角型青光眼的发病有关的基因突变，如TIGR/MYOC基因突变，OPTN基因突变等。但原发性闭角型青光眼属于多基因病，目前还没有发现与其发病明确相关的基因改变。近几年，PACG的遗传学研究热点是与发病相关的候选基因的单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism，SNP)与疾病发生的相关性研究。有国外及台湾学者报道过MMP—9基因和MTHFR基因中的某些单核苷酸多态如rs17576和C677T可能与原发性闭角型青光眼的发病有相关性。但是大陆地区还没有相关研究。
第一部分MMP—9基因单核苷酸多态与中国人原发性闭角型青光眼的相关性研究
目的：检测分析MMP—9基因中的单核苷酸多态rs17576和rs2250889的基因型及等位基因型在中国南方原发性闭角型青光眼人群与对照组人群是否存在显著差别，以发现该SNP与疾病发生的相关性。
方法：收集病例组原发性闭角型青光眼患者211例，对照白内障患者205例。性别、年龄匹配，种族及地区来源随机。抽取外周静脉血制备基因组DNA，采用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction，PCR)、限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP)及基因组DNA测序的方法，对病例组患者及对照组进行MMP基因单核苷酸多态进行检测，以确定各研究对象基因型。计数各组基因型频数和等位基因频数，应用卡方检验(SPSS13.0)进行统计分析判断各组间差异。
结果：
1) rs17576与PACG
PACG、aPACG、cPACG组与C组rs17576多态位点基因型和等位基因型分布均达到Hardy—Weinberg平衡(HW平衡)。经卡方检验：PACG组、aPACG、cPACG组与C组比较，基因型及等位基因分布差别均无统计学意义(P>0.05)。
2) rs2250889(R574P)与PACG
PACG、aPACG、cPACG组与C组rs2250889多态位点基因型和等位基因型分布均达到Hardy—Weinberg平衡(HW平衡)。经卡方检验，PACG、cPACGA组与C组间该多态位点的基因型和等位基因型分布存在显著差异：PACG组与C组比较，基因型分布X2=11.04(P=0.004)，等位基因分布x2=11.11(P=0.001)；cPACG组与C组比较，基因型分布x2=10.00(P=0.007)，等位基因分布x2=9.53(P=0.013)；aPACG组与C组比较，基因型分布x2=6.48(P=0.039)，等位基因分布x2=6.20(P=0.013)。经Bonferroni矫正，α/3=0.05/3=0.017。具有G等位基因的PACG、aPACG、cPACG患者发病风险较C等位基因者相比明显增高(OR=1.76，95％CI:1.264-2.449；OR=1.66,95％CI:1.112-2.491；OR=1.83,95％CI:1.24-2.69)。
此外，在9个研究对象中发现连锁突变：当rs2250889位点基因型为GG纯合或G/C杂合时，rs2250889前一位的单个碱基可发生突变：c.1720C>A，但不引起编码氨基酸改变。这是一个之前没有报道过的新的同义突变SNP。
第二部分MTHFR基因单核苷酸多态C677T与中国人原发性闭角型青光眼的相关性研究
目的：检测分析MTHFR基因中的单核苷酸多态C677T的基因型及等位基因型在中国南部地区原发性闭角型青光眼人群与对照组人群是否存在显著差别，以发现其与疾病发生的相关性。
方法：收集病例组原发性闭角型青光眼患者211例，对照组白内障患者205例。性别、年龄匹配，种族及地区来源随机。抽取外周静脉血制备基因组DNA，采用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction，PCR)及限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP)的研究方法，对病例组患者及对照组进行MTHFR基因单核苷酸多态C677T进行检测，以确定各研究对象基因型。计数各组基因型频数和等位基因频数，应用卡方检验(SPSS13.0)进行统计分析判断各组间差异。
结果：PACG、aPACG、cPACG组与C组C677T多态位点基因型和等位基因型分布均达到Hardy—Weinberg平衡(HW平衡)。经卡方检验，PACG、aPACG、cPACG组与C组间该多态位点的基因型和等位基因型分布无显著差异(P>0.05)。
结论：本课题采用限制性片段多态和基因组测序等方法检查中国南方地区人群中PACG患者与对照组人群中的单核苷酸多态：MMP—9基因中的rs17576、rs2250889和MTHFR基因中的C677T，以推断该单核苷酸多态与PACG发生的相关性。得出以下结果：
1、在中国南方地区人群中，MMP—9基因中单核苷酸多态rs17576 AA基因型频率及等位基因频率在对照组与PACG、aPACG组、cPACG组直接无显著差异(P>0.01)。推测rs17576与PACG的发生无相关性。
2、在中国南方地区人群中，MMP—9基因中的单核苷酸多态rs2250889 G/G基因型频率与G等位基因频率分布在对照组与PACG、cPACG组直接存在显著差异。具有G等位基因的人群发生PACG的风险较具有C等位基因的人群高。并且我们发现在9位患者中当该多态为G时，其前一位碱基可突变为A，但不改变氨基酸编码。在正常对照组中我们没有发现该连锁突变。
3、在中国南方地区人群中，MTHFR基因中C677T多态的TT基因型频率与T等位基因频率分布在正常对照组与PACG、aPACG和cPACG组直接没有明显差别，推测该多态与PACG的发生没有相关性。