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随着肉鸡生长速度和饲料转化效率的不断提高,鸡肉产品的品质问题日益突出,难以满足消费者对优质畜产品日益增长的需求。肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)作为改善鸡肉品质的重要经济性状,其沉积调控是近年来肉鸡领域的研究热点。受到生理特点、表型精准度等多种因素的限制,目前对于鸡IMF沉积机理的解析仍非常有限。本研究基于IMF选择系和对照系胸肌组织中脂质代谢差异,借助高通量测序技术挖掘影响IMF性状的关键基因,解析鸡IMF沉积的分子机理,为优质肉鸡生产提供理论支撑。随机选取第十六世代IMF选择系(n=256)和对照系(n=264)共计520只母鸡,测定胸肌组织中IMF含量、脂质组成及脂肪酸组成。结果表明,IMF的主要组分中仅甘油三酯(Triglyceride,TG)含量在选择系中显著地高于对照系(P<0.01),且与IMF含量呈正相关。另外,发现C14:0、C16:1以及C18:1n9c等长链脂肪酸比例增加可能有利于TG合成,从而引起选择系胸肌组织中IMF含量的增加。首先利用鸡55K SNP芯片对IMF选择系和对照系各30只随机个体进行群体结构和选择信号分析,证明两个系存在遗传分化;之后对IMF选择系和对照系共520只母鸡进行全基因组重测序。全基因组关联分析(Genome-wide association analysis,GWAS)发现1号染色体上存在长约1.657 Mb与胸肌TG含量性状关联的QTL,其中包括24个与性状显著关联的SNPs,突变后均有利于提高胸肌TG含量;采用GWAS与选择信号联合分析将影响TG含量的染色体区域缩减至424 Kb(chr1:31,826,000-32,250,000)的区域;结合基因注释和胸肌发育转录组表达分析,鉴定出SLC16A7与LRIG3可能为调控鸡胸肌组织TG合成的候选基因。利用胸肌TG高低组个体的转录组数据,发现SLC16A7和脂肪酸代谢以及甘油三酯酯化相关的ACLY、ACSL5、CD36、CITED4、ELOVL5、ELOVL7、FABP4、FABP5、FADS2、SCD5、LPL、PLIN1、PPARG和RXRG等基因在高TG组中表达显著升高(P<0.05),而脂解相关基因的表达显著降低或者无差异;进一步的加权基因共表达网络分析发现,SLC16A7与ACSL5、CITED4、ELOVL5、ELOVL7、FABP5、FADS2、PLIN1、PPARG和RXRG等基因存在共表达关系,且均与TG含量、IMF含量和C14:0、C14:1、C16:0、C16:1和C18:1n9c等脂肪酸含量存在显著正相关。对SLC16A7与其共表达基因进行KEGG分析发现,经典的介导脂肪代谢的PPAR信号通路被显著富集。而LRIG3在高低TG组表达并不差异,且与TG、IMF、C14:0、C14:1、C16:1和C18:1n9c等脂肪酸含量均不显著相关。以上结果提示SLC16A7在鸡胸肌中参与了TG合成的调控。综上,本研究鉴定SLC16A7是选择系肌肉组织中TG合成的关键调控基因;发现了鸡肌肉组织中一种IMF沉积调控新途径:SLC16A7与脂肪酸代谢、脂肪沉积相关的基因共表达,调控脂肪酸(C14:0、C14:1、C16:0、C16:1和C18:1n9c等)代谢进而促进TG沉积。