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[目的]回顾2006-2015年医院科研投入和产出情况,分析可能影响科研产出的因素,为医院科研发展提供参考和决策依据。[方法]以云南省某三甲医院为研究现场,确定科研投入和产出相关指标,采用定量与定性研究相结合的方法,收集医院2006-2015年科研投入和产出相关数据,访谈科研管理人员和科研人员,通过多重线性回归统计方法,分析医院科研产出的相关性和影响因素。[结果]1、科研投入指标为科研人员、实验室面积、科研奖励等7个指标。科研产出指标为科研立项、科研成果获奖、SCI、专著等13个指标。2、科研投入方面:中高级职称人员构成比逐年增高,博士学历人才引进数量呈下降趋势,外出进修和短期培训人数逐年增加,以参加国内进修和会议为主,物力和财力投入均呈现上升趋势;3、科研产出方面:科研各项产出在数量和质量上均呈现上升趋势,其中2008年首次获得国家级项目,2012和2015年分别获得国家自然科学基金重点项目,2014年科研成果首次获得省级一等奖两项;4、采用相关性分析得知各科研投入指标与科研产出呈正相关,从多元回归统计结果得知,科研产出的主要影响因素是科研人员、人才引进、科研经费投入、科研奖励四个方面。[结论]1、医院科研整体发展态势良好,科研投入不断加强,科研产出逐年增加;2、科研投入和产出具有高相关性,增大投入科研有效提高科研产出;3、科研人员、人才引进、科研经费投入、科研奖励是影响医院科研产出的主要科研投入因素,应优化科研资源投入;4、高学历科研人才缺乏,特别是博士学位人才;5、科研产出水平深度和广度不高,科研转化能力不足;6、科研人员水平两极分化明显,科研意识有待进一步提高;7、未建立有效的科研投入产出绩效评价制度,科研活动缺乏客观评价。