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到目前为止，有关DNA测序用荧光标记染料的研究大多集中在咕吨类、菁染料和氟硼吡咯类等，但都有其自身的缺点。本论文创新之处在于设计、合成了一类新型长波长荧光染料用于DNA序列测定，弥补了传统染料的不足。首先利用高度缺电子的共轭体系8-氧-8H-苊并[1，2-b]吡咯-9-腈(荧光母体1)和8-氧-8H-苊并[1，2-b]吡咯-9-甲酸甲酯(荧光母体2)与不同亲核能力的氧、硫、氮试剂反应，得到了四个发射波长长、量子产率高的荧光化合物，探讨了荧光母体1和2与不同亲核试剂的反应特性；同时对这些DNA测序用荧光标记染料前体化合物在三氯甲烷、无水乙醇中的光谱性能进行了研究。另一方面，为了能将这些化合物标记到不同的碱基上，同时改善其水溶性，调节个别化合物光谱性能，分别引入了不同的长链羧酸，合成了5个新型的荧光标记化合物。这些化合物结构均经过IR、1HNMR、HRMS(ESI)的确证。同时研究了这些化合物在水、乙醇中的光谱性能。研究结果表明化合物系列L1、L4、L5和L1、L2、L5较为适合四色测序中长波段的三个荧光染料，而化合物系列L1和L3适合双色/单通道的DNA序列分析中标记的荧光染料。