基因芯片分析联合RNA干扰对膀胱癌Biu-87细胞株端粒酶活性及其增殖的影响

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目的:探讨联合siRNA(small interfering RNA,小型干扰RNA,siRNA)干扰hTR(human telomerase RNA,人端粒酶RNA,hTR)及hTERT(human telomerase reverse transcriptase,人端粒酶逆转录酶,hTERT)基因对膀胱癌BIU-87细胞株端粒酶活性抑制的影响,为RNAi(RNA interfering,RNA干扰)在膀胱癌基因治疗中提供新的依据。   方法:根据人源性TR mRNA和TERT mRNA的序列,分别设计合成3对不同且能干扰TR和TERT基因表达的siRNA并筛选出最高效抑制序列(pRNAT-TR-Ⅲ、pRNAT-TERT-Ⅲ),构建以hTR、hTERT基因为靶点的联合siRNA干扰装置pRNAT-TR-Ⅲ、pRNAT-TERT-Ⅲ并将其转染膀胱癌BIU-87细胞株,采用MTT法检测BIU-87细胞的生长抑制情况、荧光定量PCR和端粒酶活性检测评价基因表达情况,并对联合siRNA前后进行基因芯片分析,采用RNA抽提、RNA质量检测、cRNA标记与合成、芯片杂交、化学发光检测、图象采集和数据分析,并进一步采用RT-PCR验证部分基因表达差异。   结果:pRNAT-TR-Ⅲ,pRNAT-TERT-Ⅲ分别干扰及pRNAT-TR-Ⅲ、pRNAT-TERT-Ⅲ联合干扰都可以特异抑制膀胱癌BIU一87细胞株中TR和TERT的表达(分别减少pRNAT-TR-Ⅲ:41%,pRNAT-TERT-Ⅲ:57%,pRNAT-TERT-Ⅲ、pRNAT-TR-Ⅲ TERT:70%,P<0.05)。且膀胱癌BIU-87细胞株的生长和端粒酶活性均明显受到抑制,以联合 RNA干扰尤为明显(pRNAT-TERT-Ⅲ:1.80±0.014,pRNAT-TR-Ⅲ:1.95±0.016,pRNAT-TERT-Ⅲ、pRNAT-TR-Ⅲ:1.25+0.012,P<0.05)。联合siRNA干扰后进行基因芯片分析发现21个基因下调(ATM、BAX、BCL2、BCL2L1、BIRC5、CD44、CTNNB1、E2F1、JUN、MCAM、MTA1、MYC、NFKB1、NFKBIA、NME4、PNN、PNN、SERPINE1、THBS1、TNFRSF1A、UCC1)。   结论:成功构建了针对TR和TERT基因的siRNA,并从中筛选出能特异且高效阻断TR和TERT表达的siRNA;联合siRNA干扰TR和TERT基因能更明显抑制膀胱癌BIU-87细胞株的生长:联合siRNA抑制膀胱癌BIU-87细胞株生长的原因是21个基因下调,为临床应用奠定了基础。
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