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疟疾是一种十分严重的热带病,在感染人的4中疟原虫中恶性疟原虫的毒性最强,死亡率极高。疟原虫的生活史复杂,需要两种类型的宿主-雌性按蚊和人。在人体内有红外期和红内期两个发育阶段,但是其主要临床症状发生在红内期阶段。全基因组测序的完成及后继的芯片技术、高通量测序技术的快速发展,恶性疟原虫中的非编码RNA (ncRNA)也越来越引起人们的关注。ncRNA从长度上可以分为3类:小于50 nt的小片段ncRNA; 50 nt到500 nt的中等长度ncRNA;大于500 nt的长链ncRNA (Long non-coding RNA, lncRNA)。通过数据库数据比较基因组学分析,在恶性疟原虫中没有找到Dicer、Piwi、PAZ或RdRp的同源区域,因此认为恶性疟原虫中没有内源性小RNAs的存在。因此,中等长度的ncRNA引起了广泛关注。对于疟原虫中等长度组成型ncRNA的研究比较成熟,如tRNA、rRNA这些RNA不被翻译成蛋白质,但是参与蛋白质的翻译过程:此外还有snRNA、 snoRNA等参与RNA剪接和RNA修饰。Chakrabarti等鉴定出6个新的未知功能的RNA (RNAs of unknown function,简称RUFs),其中RUF5、6仅在恶性疟原虫与里氏疟原虫中存在,RUF6包括15条高度同源的序列,长度在144-160 nt,这些同源序列位于RIFIN或VAR的基因间区。恶性疟原虫变异抗原基因(Var基因)家族编码的恶性疟原虫红细胞膜蛋白1(PfEMP1)是介导恶性疟原虫抗原变异和红细胞粘附微血管的媒介。PfEMP1由恶性疟原虫分泌产生,然后转移到感染的红细胞膜上,并在红细胞表面蓄积而形成结节,PfEMP1介导的细胞粘附和恶性疟原虫的致病性密切相关。这些RUFs是否参与了Var基因的调控以及调节疟原虫红细胞内期的发育分化及其内在调节机制仍不清楚。本研究通过Northern blot、FISH、转染、RNA-Seq、qRT-PCR、双荧光素酶实验等实验首次揭示了RUF6中第15条同源簇(RUF6-15)的生物学功能。在野生型3D7虫株每一个生活周期中RUF6-15中的转录水平是随着生长发育时间的延长越来越多,转录后位于细胞核内参与调控作用。转染过表达RUF6-15的虫株与对照株相比生长速度更快,敲低RUF6-15的虫株与对照株相比生长速度变慢。通过过表达RUF6-15后转录本水平的高通量测序结果及实验室验证结果显示,RUF6-15的靶基因为var基因家族。进一步通过双荧光素酶实验验证了RUF6-15是通过结合Var基因5’UTR区来调控var的表达。粘附实验表明过表达RUF6-15的虫株粘附能力有明显的提升,RUF6-15敲低的虫株粘附能力有所降低。本研究首次揭示了RUF6-15的生物学功能及作用机制,对深入认识疟疾的发病机制和制定新的防治措施均意义重大。