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目的:
建立传统经典方法与分子生物技术相结合的系统化微生物鉴定模式,提高临床标本中可培养、难培养、不可培养病原菌的鉴定准确性和敏感性。
方法:
(1)将临床分离株、经VITEK32系统鉴定,%id<99.9凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)128株,按鉴定率高低分为三组:Ⅰ组:%id90~9845株,Ⅱ组:%id80~9053株,Ⅲ组:%id<8030株,分别用分子检测技术——16S rRNA基因序列分析法鉴定,比较VITEK32和16S rRNA基因序列分析法鉴定结果的一致性,两种方法鉴定结果不一致的菌株用API Staph系统鉴定。
(2)对47位北京同仁医院眼科诊断为眼内炎患者的玻璃体样本,同时进行直接涂片、微生物培养、生化表型鉴定、16S rRNA基因PCR和序列分析,比较不同检测方法的敏感性和特异性。
结果:
(1)Ⅰ组样本45株,VITEK32系统和16S rRNA基因序列分析法鉴定结果完全一致;Ⅱ组样本53株,VITEK32系统和16S rRNA基因序列分析法鉴定结果一致的有45株,不一致的有8株;Ⅲ组样本30株,VITEK32系统和16S rRNA基因序列分析法鉴定结果一致的有20株,不一致的有10株。不一致的样本,API法鉴定结果与16S rRNA基因序列分析法相同。
(2)47例玻璃体样本,直接涂片革兰染色检测、传统培养法检测、非培养PCR法检测阳性率分别为16/47、17/47、25/47,合计阳性率为32/47;三种检测方法报告时间最快分别为涂片法1小时,PCR法4小时,细菌培养法初步结果24小时。
结论:
16S rRNA基因序列分析法鉴定结果稳定可靠,非培养PCR法检测阳性率高,临床实验室有条件可将分子微生物诊断技术,如16S rRNA基因PCR和序列分析法引入常规检测流程。将传统经典方法与现代分子技术相结合,建立系统化微生物鉴定的新型模式,提高可培养、难培养、不可培养病原菌的检出率,为深入研究病原微生物的感染机理提供有效的手段。