基于度量学习的小样本人类大脑分割算法研究

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近年来,利用深度神经网络(Deep Neural Networks,DNNs)进行医学图像分割取得了显著的进展。然而,深度神经网络通常需要大量的数据和标注进行训练,对于医学图像,图像采集设备及患者隐私等问题导致数据与标注都代价高昂且难以获取。为解决此问题,本文提出了一种基于距离度量学习(Distance Metric Learning,DML)的小样本(单样本和少样本)医学图像通用分割框架。现有的大多数方法解决的是拥有大量数据的情况下缺乏人工标注的问题,但是本文提出的的框架在数据与标注都极度匮乏的情况下工作,这是应对罕见疾病的理想方法。该框架通过DML学习每种类别的多峰混合描述,并根据待分割图像像素点的嵌入向量与类别描述之间的余弦距离进行密集预测。多峰混合描述有效地利用了对象间的相似性和类内的差异性来克服由于极其有限的数据而导致的过拟合。另外,本文提出了用于多峰混合分布的自适应混合系数,以自适应地选择更适合当前输入的峰。这些类别描述被隐式地嵌入到全连接层的权重之中,从而可以通过前向传播有效地计算余弦距离。除自适应混合系数外,该框架另外采用了三种针对医学图像特征而进行改进的策略以使框架获得更好的性能。在大脑磁共振图像上进行实验,本文提出的框架与标准DNN(3D U-Net)和经典配准(ANTs)方法相比,在小样本医学图像分割实验中得到了良好的结果。使用单例样本及标注进行分割训练时,平均Dice系数在大脑磁共振图像上达到了 81%,相比之下,U-Net和ANTs分别为52%和72%。为进一步验证框架在其他图像模态和身体其他组织器官图像上进行分割的能力,本文使用提出的框架在腹部CT数据集以及乳腺超声图像上进行了实验,同样得到了良好的结果。另外,尽管本研究针对的实际实验背景与一些现有前沿方法不同,但本文依旧通过合理的修改实验条件设置把该框架与一些现有的前沿方法(包括小样本学习和非小样本学习)进行了比较,通过实验数据进一步说明了提出框架的适应性和有效性。
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