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望天树(Parashoreachinensis)隶属于龙脑香科(Dipterocarpaceae)柳安属(Parashorea)，是热带雨林的标志树种之一，国家一级保护植物。龙脑香科于第三纪早期到达东南亚，迅速分化发展，经历过第四纪冰期，其现在的遗传结构和地理分布受第四纪冰川影响很大。其现有居群主要分布在古热带植物区中的北部湾和滇缅泰地区，即云南南部、东南部与越南和老挝北部以及我国广西西南部，目前居群分布范围和居群个体数都很小，处于严重濒危状态。 本研究通过研究基础和分子进化背景可靠的细胞核基因片段DNA序列信息，采用居群采样的方法，同时结合群落生态学资料、化石资料、地质历史事件、及末次冰期植被重建的资料，对望天树的亲缘地理学开展研究；推测第四纪冰期望天树的避难所，并对现有居群的遗传多样性及遗传结构进行分析，并探讨以往地质历史事件对我国热带雨林分布的影响。主要研究结果如下： 在中国的7个望天树居群以及越南2个居群共49个个体中，PgiC序列共检测到22个单倍型类型。望天树物种水平的核苷酸多样性(p)为0.00226，单倍型多态性(h)为0.763，总体遗传多样性水平高。云南南部版纳地区居群(DYD、HYH、BSH)一共有16个单倍型，其中13个为该地区的特有单倍型，居群HK的单倍型数为7，2个为该地区的特有单倍型，广西TY、越南Cuc和PuM居群单倍型数最少仅为2。望天树遗传变异主要存在于居群内(68.74％)，但居群间已经发生了相当程度的分化。 在地理分布上，多样性中心位于云南南部版纳和东南部河口。越南居群的遗传多样性明显低于中国居群。DNA单倍型分布、单倍型系统发育分析表明云南南部版纳和东南部河口为望天树第四纪冰期时候的避难所。冰期后，望天树居群并没有经历过明显的居群扩张。为了保护避难所地区的遗传多样性，应对避难所居群实施就地保护策略；迁地保护及育种时，尽可能在多个居群中取样，最大限度地保护望天树的遗传多样性。