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鄱阳湖位于长江中下游结合部南岸，江西省北部，是中国最大的淡水湖泊，也是目前长江仅有的三个通江湖泊之一。鄱阳湖是受江、河水位制约水量吞吐平衡而形成的过水性、吞吐型、季节性的湖泊，洪、枯水位面积相差极大。
本文以2010～2011年间于鄱阳湖及邻近水系(赣江、长江、洞庭湖)采集的不同生态类型的六种代表性鱼类，即刀鲚(Coilia nasus)，短颌鲚(Coiliabrachygnathus)，银鲴(Xenocypris argentea)，蛇鮈(Saurogobio dabryi)，红鳍原鲐(Cultrichthys erythropterus)和鳜(Siniperca chuatsi)为研究对象，结合形态与分子生物学方法，研究鄱阳湖及邻近水系鱼类的形态、遗传分化，探讨种群差异形成的原因、分化机制及鱼类的群落生态过程。主要研究结果如下：
1.采用耳石微化学法鉴定鄱阳湖鲚鱼群体，发现鄱阳湖存在河海洄游性刀鲚和淡水生活的短颌鲚两个类群，其在形态和遗传结构上(线粒体Cytb序列和核基因Rag1序列)均具有显著的差异，认为短颌鲚是不同于刀鲚的有效种。
2.鄱阳湖及邻近水域(赣江、洞庭湖)银鲴的7个地理种群间具有一定的形态差异，尤其是赣江种群与其他种群间形态差异显著；线粒体Cyt b遗传多样性较高，但各地理种群间无明显差异，相互间存在广泛的基因的交流。认为银鲴不同地理种群间的形态差异主要是其对特定环境适应的结果，而不是遗传分化所产生的。种群间广泛的基因交流与银鲴江湖洄游的生态习性有关。
3.鄱阳湖及邻近水域(武汉、洞庭湖)蛇鮈的6个地理种群间已具有一定的形态差异；线粒体Cyt b遗传多样性较高，但各地理种群间无明显差异，相互间存在广泛的基因交流。认为蛇鮈不同地理种群间的形态差异主要是其对特定环境适应的结果，而不是遗传分化所产生的。种群间广泛的基因交流与其产漂流性卵有关，还受到鄱阳湖季节性、吞吐性的湖泊特征影响。
4.鄱阳湖及洞庭湖红鳍原鲌的6个地理种群间已具有一定程度的形态差异；基于线粒体Cyt b序列差异分析显示，洞庭湖种群与鄱阳湖群体己产生显著的遗传分化，表明红鳍原鲌的洞庭湖种群与鄱阳湖群体间基因交流受限。这种种群格局与红鳍原鲌的定居性生活特性有关，还受到鄱阳湖季节性、吞吐性的特征影响。
5.鄱阳湖及邻近水系(赣江、洞庭湖)鳜的7个地理种群已具有一定程度的形态差异；基于线粒体Cyt b序列差异研究显示，部分地理种群间产生遗传分化，但形态上差异较大的种群与遗传上有分化的种群不相对应，显示了鳜复杂的种群格局，其种群间基因交流与阻隔共存。这种种群格局与其定居性的生活特性有关，还受到鄱阳湖季节性、吞吐性的湖泊特征影响。
综合以上研究结果可见，鄱阳湖内部及与邻近水系鱼类种群之间存在不同程度的形态差异，其遗传关系和基因交流也具有很大的多样性，有的物种与邻近水系之间遗传交流密切，有的物种则存在一定的区域分化。这种多样性与不同生态类型的鱼类在鱼类群落中的时空动态有关，是鱼类群落生态过程的某种体现。