论文部分内容阅读
研究背景：
糖尿病肾病(diabetic nephropathy，DN)是糖尿病(diabetes mellitus，DM)的慢性微血管并发症，同时是糖尿病主要致死原因之一。DN的发病机制至今尚未完全阐明，除了环境因素外，遗传因素已经被证实是DN发病的重要一环。根据流行病学及家系调查显示，DN的发生发展具有遗传易感性。转录因子7类似物2(transcription factor7-like2，TCF7L2)基因是Wnt信号通路的组成成分，参与细胞的增殖和分化，已经有大量的研究证实TCF7L2基因多态性与DM相关；进一步的研究指出，在糖尿病及非糖尿病患者中，TCF7L2基因多态性与慢性肾功能损害相关，其单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)位点rs7903146的风险等位基因T的携带者肾小球滤过率(glomerular filtration rate，GFR)比非携带者更低，且cystatin C含量更高，故推测TCF7L2基因多态性可能与DN存在着相关性。由于种族差异、环境暴露因素、病例选择及研究方法的不同会造成不同的结果，且目前还没有针对TCF7L2基因多态性与中国汉族人群DN相关性的研究，因此还应在这一领域进行更多、更深入的研究。
研究目的：
1.探讨中国南方汉族人群中TCF7L2基因多态性SNP rs7903146和rs290487的分布情况。
2.探讨TCF7L2基因多态性与糖尿病肾病的相关性。
研究方法
应用聚合酶链反应—单链构象多态性(Polymerase Chain Reaction—Single Strand Conformation Polymorphism，PCR—SSCP)结合直接测序的方法，检测420例中国南方汉族无亲缘关系的个体TCF7L2 SNPs rs7903146、rs290487的分布情况。研究对象共分为三组：正常对照组(N组)169例，糖尿病非肾病组(NDN组)115例，糖尿病肾病组(DN组)136例，对各组等位基因频率、基因型频率进行比较分析。应用SAS8.0统计软件进行数据分析。
实验结果：
1.正常对照组、NDN组和DN组均存在TCF7L2基因SNP rs7903146和rs290487多态性位点。rs7903146基因型在NDN组和DN组中的分布均符合Hardy—Weinberg平衡(NDN组x2=0.24，P=0.63；DN组x2=1.26，P=0.26)；而在正常对照组的分布却偏离Hardy—Weinberg平衡(x2=13.2，P<0.01)，可能与rs7903146次要等位基因频率(minor allele frequency，MAF)在中国汉族人群中太低(T％=3.8％)有关。rs290487基因型在正常对照组、NDN组、DN组中的分布均符合Hardy—Weinberg平衡(正常组x2=0.gg，P=0.32；NDN组x2=0.64，P=0.42；DN组x2=0.19，P=0.66)，提示样本具有群体代表性。
2.SNP rs7903146的基因型C/C、C/T、T/T在正常对照组的分布频率分别为93.5％、5.3％、1.2％；NDN组的分布频率分别为91.3％、8.7％、0；DN组的分布频率分别为90.4％、8.8％、0.7％。C/C基因型和(C/T+T/T)基因型在各组中的总体分布差别无统计学意义(x2=1.02，P=0.601)。次要等位基因T在正常对照组、NDN组和DN组的分布频率分别为3.8％、4.3％和5.1％。等位基因在在各组中的分布也无统计学意义差别(x2=0.61，P=0.737)
3.SNP rs290487基因型T/T、C/T、C/C在正常对照的分布频率分别为40.2％、49.1％、10.7％；在NDN组的分布频率分别为：39.1％、49.6％、11.3％；在DN组的分布频率分别为28.7％、51.5％、19.9％。各组间基因型的总体分布差别无统计意义(x2=8.59，P=0.072)。但是DN组与正常对照组相比较基因型分布差异有统计学意义(x2=7.27，P=0.026)。DN组中T/T基因型的频率低于正常对照组(x2=4.42，P=0.035)；C/C基因型的频率高于正常对照组(x2=5.07，P=0.024)。DN组与NDN组以及NDN组与正常对照组比较，各基因型分布无统计学意义的差别(x2分别为4.94和0.051，P分别为0.08和0.945)。次要等位基因C在正常对照组、NDN组和DN组的分布频率分别为35.2％，36.1％和45.6％。DN组次要等位基因C的分布频率(45.6％)显著高于NDN组(36.1％)和正常对照组(35.2％)(x2分别为4.64和6.78，P分别为0.03和0.009)。NDN组与正常对照组相比较，等位基因分布无统计学意义的差异(x2=0.049.P=0.83)。
4.SNP rs290487基因型C/C携带者的DN患病率为67.5％，显著高于T/T基因型的46.4％(x2=4.83，P=0.028；OR=2.40，95％CI：1.089-5.272)。C/T基因型携带者的DN患病率(55.1％)与T/T基因型(46.4％)相比，差别无统计学意义(x2=1.53，P=0.216；OR=1.42，95％CI：0.81-2.46)；与C/C基因型相比，差别也无统计学意义(x2=1.92，P=0.17；OR=0.59，95％CI：0.28-1.25)。等位基因C携带者的DN患病率为59.9％，显著高于等位基因T的50.2％(x=4.64，P=0.031；OR=1.48，95％CI：1.04-2.13)。
结论：
1.正常对照组、NDN组和DN组均存在TCF7L2基因SNP rs7903146和rs290487多态性位点。rs7903146的基因型C/C、C/T、T/T在正常对照组的分布频率分别为93.5％、5.3％、1.2％；NDN组的分布频率分别为91.3％、8.7％、0；DN组的分布频率分别为90.4％、8.8％、0.7％。次要等位基因T在正常对照组、NDN组和DN组的分布频率分别为3.8％、4.3％和5.1％。rs290487基因型T/T、C/T、C/C在正常对照的分布频率分别为40.2％、49.1％、10.7％；在NDN组的分布频率分别为：39.1％、49.6％、11.3％；在DN组的分布频率分别为28.7％、51.5％、19.9％。次要等位基因C在正常对照组、NDN组和DN组的分布频率分别为35.2％，36.1％和45.6％。
2.TCF7L2基因多态性与DN发病相关。携带rs290487等位基因C的DM人群DN患病风险高于非携带者，且C/C基因型DN患病风险比T/T基因型高。尚不能证实SNP rs7903146与DN的发病相关，但有可能是由于其次要等位基因在中国人群中携带率低且本研究样本量少。