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目的：本研究旨在探讨新生儿肠道病毒感染的临床特点与病原学的相关性，特别是肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇A组16型（CoxA16）、埃可病毒30型（E30）及副埃可病毒在新生儿中的感染情况；并了解其感染的临床特点及季节、年龄和性别的分布情况，以便早诊断、早隔离、早治疗。方法：采集2011年1月-12月584例新住院的新生儿的粪便标本，用逆转录－聚合酶链反应（RT-PCR）检测EV通用型、EV71、CoxA16、E30及副埃可病毒，出院时（住院14天），对部分肠道病毒感染的患儿再次检查EV通用型；同时采血进行血常规、血糖、肝功能、心肌酶等检查；并对临床资料进行分析。结果：2011年长春市儿童医院新生儿粪便标本肠道病毒通用型阳性检出率为11.98%（70/584），其中EV71阳性检出率为11.43%（8/70），CoxA16、E30和副埃可病毒均未检出；EV感染的季节分布，发病高峰月份为7～8月；性别分布：男女之比1.5：1；年龄分布：发病高峰年龄为20～28日龄；临床症状发热41例，58.57%；腹泻40例，57.14%；拒乳10例，14.29%；呕吐12例，17.14%；皮疹23例，32.86%；心肌损害（心电图心肌缺血、心肌酶增高）29.41%；神经系统并发症（惊跳/震颤/拒乳/嗜睡）22.86%，呼吸系统并发症（支气管炎、支气管肺炎）55.71%。复查的22例肠道病毒感染的患儿，EV通用型仍为阳性20例，阴性2例。EV71感染患儿，发热100%；皮疹6例，75%，皮疹为细小红色皮疹，3天左右消失，不留痕迹，与婴幼儿手足口病例皮疹特点不同；所有患儿经治疗，均临床治愈出院，平均住院天数为8.83±1.79天。结论：1、新生儿中存在肠道病毒感染，2011年主要为EV71型感染；2、新生儿肠道病毒感染有明显季节性（7～8月份）；3、新生儿肠道病毒感染存在明显的高发年龄段（20-28日龄）；4、新生儿肠道病毒感染，主要表现为腹泻、发热、皮疹、循环障碍、心肌损害等表现，EV71感染患儿发热比例高；5、新生儿肠道病毒感染2周仍通过便中排毒。