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本文根据2013年11月（秋）和2014年2月（冬）、5月（春）、8月（夏）四个季节在南麂列岛海洋自然保护区潮间带调查所获大型底栖藻类数据，对南麂列岛海洋自然保护区潮间带大型底栖藻类的种类组成、数量分布、优势种以及多样性进行了研究。本次调查共鉴定出大型底栖藻类42属59种，其中红藻门(Rhodophyta)最多，共计25属37种，其次是褐藻门(Phaeophyta)，9属11种，绿藻门(Chlorophyta)第三，共6属9种，蓝藻门(Cyanophyta)最少，共计2属2种。春季藻类属种最多（37属47种），冬季次之（25属34种），夏季第三（19属23种），秋季最少（16属19种），在四个季度都出现的藻类共11种。优势度指数表明南麂列岛海洋自然保护区潮间带大型底栖藻类中四个季节均为优势种的只有鼠尾藻1种，三个季度都为优势种的也只有珊瑚藻1种，在一个季度中成为优势种的藻类共有7种，没有在两个季节中成为优势种的大型底栖藻类，由优势种更替率r值可知南麂列岛潮间带大型底栖藻类的季节演替现象非常明显。生物量总体呈现出南麂列岛自然保护区东部藻类生物量＞西部藻类生物量＞中部生物量的趋势，从季节上看，平均生物量春季＞冬季＞秋季＞夏季。Shannon-Winner指数(H）春季最高，冬季次之，夏季略低于冬季，秋季最低;Margalef丰富度指数（d)的季节变化与Shannon-Winner指数(H）相同;Pielou均匀度指数(J)则是春季＞夏季＞冬季＞秋季。 将调查数据整理并录入到南麂列岛生物多样性地理信息系统，根据研究结果使用ArcGIS软件绘制了南麂列岛潮间带调查断面分布图、藻类生物量分布图、调查断面藻类多样性指数专题图。使用ArcGIS软件进行距离分析和地形分析，结合藻类调查数据进行研究结果表明:调查断面与南麂岛之间的距离和调查断面春季生物量之间存在弱相关关系，和生物多样性指数之间不存在相关关系。除在10°-20°坡度范围内调查断面的生物量异常外，生物量随着坡度的增加而减少，并且藻类的群落结构随着坡度的改变而发生变化;就全年潮间带大型底栖藻类生物量而言，阴坡坡向藻类生物量＞阳坡坡向藻类生物量＞半阳坡坡向藻类生物量＞半阴坡坡向藻类生物量，并且不同坡向的大型底栖藻类生物量随季节的变化程度存在明显差异。 通过本次研究可发现，应用ArcGIS软件分析南麂列岛潮间带藻类分布是可行的，有一定的参考价值。