DHV地方株部分生物学特性研究与基因组ORF序列分析

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:LQ0121
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鸭病毒性肝炎(duck viral hepatitis,DVH)是由鸭肝炎病毒(duck hepatitis virus,DHV)引起雏鸭的一种急性、高度接触性传染病。近几年来,鸭病毒性肝炎出现了新的流行趋势,标准DHV—Ⅰ弱毒疫苗或其抗体对雏鸭鸭肝炎的保护效果不甚理想。本文通过对广东分离的2株DHV的部分生物学特性研究,DHV开放阅读框各基因的序列对比分析,综合分析VP0、VP3、VP1蛋白的特性,探讨本地区近几年鸭病毒性肝炎的流行趋势及变异情况,力求解释标准DHV—Ⅰ弱毒疫苗或其抗体对雏鸭鸭肝炎疫情的保护效果不理想的原因。 本研究采用鸭胚尿囊腔接种的方法,将鸭病毒性肝炎SN株及GD—B株复苏增殖,2株病毒均能致死鸭胚、鸡胚;通过对两毒株的鸡胚半数致死量(CELD50)的测定,初步确定两毒株的毒力强弱,通过试验得出,SN株的CELD50为10-4.68/0.2 mL,GD—B株的CELD50为10-4.62/0.2mL;根据中和试验的结果,标准Ⅰ型阳性血清对SN株和GD—B株的半数保护的血清稀释度(血清效价)分别为1:50(≥50阳性)和1:23.3(10~49可疑),表明标准Ⅰ型阳性血清对SN株和GD—B株免疫保护指数较低,SN株及GD—B株经过与标准强弱毒株的CELD50比较,初步确定均为中强毒力的毒株;用鸭胚成纤维细胞(DEF)对这两毒株进行培养,经RT-PCR鉴定表明,两毒株均能在DEF中增殖,且产生CPE,用其细胞培养液接种鸭胚不致死鸭胚,且胚体无任何病变。 根据GenBank发表的3株鸭肝炎病毒的全基因组序列(江苏弱毒株A66、台湾强毒株03D、广东变异株FS)设计8对特异性引物,通过RT-PCR方法扩增DHV弱毒疫苗株、SN株和GD—B株开放阅读框各基因,将扩增产物分别克隆于PMD—18T载体中,转化E.coli DH5α感受态细胞,筛选阳性克隆,对阳性克隆进行测序,并利用分子生物学软件对DHV弱毒疫苗株、SN株和GD—B株序列进行拼接,序列分析结果表明,3株毒株的ORF均为6,747nt,编码2,249个氨基酸,与DHV—Ⅰ核苷酸序列相似性为94.4~99.5%,氨基酸序列相似性为93.5~99.4%。与DHV变异株核苷酸序列相似性为72.6~73.5%,氨基酸序列相似性为79.2~84.4%。 根据VP1的氨基酸序列,绘制了DHV系统发育进化树。结果显示,参比的13株DHV可以分为两个大群,一大基因群包括本研究的3株毒株在内的DHV—Ⅰ型,这一大基因群可以细分为3个亚群,SN株和GD—B株同属于以R85952为代表的强毒株群中,弱毒疫苗株属于以A66为代表的弱毒株群中,另外一群均为在浙江分离的强毒株;另一大基因群为DHV变异株,可以分为2个亚群,一群是中国台湾变异株,另一群是中国大陆及韩国的变异株。 本研究还应用DNAStar Protean软件综合分析了VP0、VP3、VP1蛋白的二级结构、亲水性、表面特性、柔韧性和抗原指数,并对各个蛋白的B抗原表位进行了预测。结果表明VP0蛋白的B细胞表位可能在94~96区域内或附近。VP3蛋白的B细胞表位可能在1~20,176~186这些区域内或附近。VP1蛋白的B细胞表位可能在183~186,209~219这些区域内或附近。
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