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本论文主要内容分为两个部分，第一部分是中国北方地区乙肝病毒BCP及前C区变异与临床类型相关性研究；第二部分是北京地区乙肝病毒S基因序列多态性及其分布研究。
BCP和前C区在HBV生活史中起着很重要作用，其突变通过降低前基因组RNA或阻断病毒装配方式影响病毒复制。研究病毒BCP和前C区突变对于乙肝防治和预后具有重要意义。本研究对BCP和前C区进行测序和点突变及突变组合分析，并应用生物信息学方法对突变类型与临床表型关系进行分析。结果显示，中国北方156例HBV患者中，有131例患者血清病毒有BCP和前C区突变。其中1726，1727和1730突变未见于以往报道。这三个聚集突变与已知1762/1764双突变的突变组合与患者抗-HBe阳性显著性相关(P＜0.001)。C1766T/G，A1846T，G1864A和G1896A四个突变位点以及A1762T，G1764A，G1896A的突变组合也与抗-HBe阳性具有显著性相关。G1776A，A1846T，G1857A和G1896A突变位点则与HBeAg阴性显著性相关。与疾病进展相关突变位点有T1752C/A，A1762T，G1764A和G1896A。TA区中突变主要是在TA1和TA2区，在TA3区中只发现一个突变。此外，A1762T/G1764A突变与疾病进展和男性患者有显著性相关。随着患者病毒BCP和前C中突变位点增加，CSH，LC和HCC组患者比例逐渐增多，ASC和CH组患者比例则逐渐减少，特别是在大于2个突变位点组合的患者和小于等于2个突变位点组合的患者中CSH，LC和HCC组和ASC和CH组患者分布具有显著性差异(P＜0.05)。T1753C，A1762T，G1764A三个点突变组合与疾病进展显著相关。综上，中国北方地区HBV患者病毒BCP和前C区有较高的突变率，其BCP和前C区中变异与患者e抗原抗体状态和疾病进展具有相关性。
S基因编码病毒外膜主蛋白，其突变率是病毒基因组中最高的，且病毒这一区域在体内产生的变异对于乙型肝炎的准确诊断和抗病毒的疗效产生重要影响，因而从DNA水平研究其突变性质、特点、规律和功能具有重要意义和迫切性。HBV的基因型也通过S基因多态性来确定。我们采用PCR产物直接测序方法，对北京地区69例HBV患者血清病毒S基因进行测序和多态性分析，并用生物信息学方法分析HBV基因型/血清型分布及其与临床表型关系。结果显示，北京地区HBV以C型为主，其次为B型，S基因序列差异在C型中高于B型；adrq+、adw2血清亚型为优势血清亚型；DNA序列突变在S基因中呈非随机分布，疏水区突变率明显高于其它区域而两个亲水区比较保守。