小麦矮化腥黑穗病菌(Tilletia controversa Kühn)的分子检测

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小麦矮化腥黑穗病菌(Tilletia controversa kühn,简称TCK)引起的小麦矮化腥黑穗病(Dwarf bunt of wheat)是麦类黑穗病中危害最大,防治最难的一种病害,常对小麦生产造成巨大危害,同时也是我国一类检疫性病害。但是在我国日常的口岸检疫工作中我们发现小麦网腥黑穗病菌T.caries(TCT)和小麦光腥黑穗病菌T.foetida(TFL)与小麦矮腥黑穗病菌T.controversa(TCK)的冬孢子形态非常相似,这给检疫鉴定工作带来了很大的麻烦。几十年来,国内外一些学者主要从腥黑穗病菌的形态学、血清学、生化等方面进行了大量的研究探索,并取得了巨大的成果,但从分子生物学水平上对他们进行区分国内还未见报道。 利用两种分子生物学方法结合实时荧光PCR技术手段对TCK和它的两种近似种TCT和TFL进行了鉴别研究。利用RAPD方法,在目前筛选的引物中能够找出引物OperonA01(CAGGCCCTTC)鉴别出TCK和TFL,但不能鉴别出TCK和TCT;利用核糖体基因分析法,在核糖体基因的外部转录间隔区(externally transcribed spacer,ETS)和非转录间隔区(non- transcribed spacer,NTS)分别找到了TCK不同于TCT和TFL的特异性序列。并根据TCK的ETS上的特异性序列设计了Taqman探针,利用实时荧光PCR技术通过优化实时荧光PCR反应条件实现了从TCK、TCT、TFL中检测出TCK。 利用基于Taqman探针的实时荧光PCR技术可以快速、准确的实现对TCK的检测,可避免常规检测方法造成的误检、漏检,且这种检测方法相对于常规检测方法更为灵敏,整个检测过程只要2个小时,由于采用全封闭反应管及光电传导系统,不用跑凝胶电泳,因而降低了实验室常见的污染问题。
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