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“十三五”时期,国家卫计委将“健康中国”一词纳入到规划当中。这标志着我国将医药制造业的创新发展作为国家发展的重要方向,随着社会的不断发展,居民寿命显著增加,社会的老龄化问题日益显现,市场对于医药的需求逐步增大。该行业的发展关乎社会和谐、人民幸福,是建设社会主义现代化强国的重要环节。相比于发达国家,我国的医药制造业与之相比依然存在差距。国内医药制造业企业与世界先进制药企业相比研发投入强度不足,因此缺少先进技术创新成果,从而影响我国制药企业的盈利能力,此外,伴随着我国经济高速发展,各项成本费用的提升一定程度上也抑制了我国医药制造业企业的生产能力,最终限制了我国医药制造业发展。研发费用加计扣除政策作为促进企业开展科技创新活动、提高生产效率最具针对性的政策,对促进医药制造业企业发展有着不可替代的作用。为扭转当前我国医药制造业的不利局面,近些年来国家也在逐步优化当前研发费用加计扣除政策,虽取得一定积极效果但仍具备优化空间。在此形势下,完善当前研发费用加计扣除政策,发挥政策效应最大化是我们最应关注的问题。首先,本文将税收优惠对医药制造业企业发展影响的相关理论进行分析。在对研发费用加计扣除政策的基本概念及其政策作用机理进行详细阐述后,从供给层面的收入效应与替代效应、“市场失灵”理论、利润函数模型三方面分别论证了研发费用加计扣除政策与医药制造业企业生产、创新、盈利能力的关系。其次,本文结合研发费用加计扣除政策演进历程与医药制造业发展现状,对研发费用加计扣除政策从扣除范围与优惠力度两个角度进行系统化的梳理,在政策发生变动调整年间观察医药制造业生产、创新、盈利水平的变化趋势与幅度,总结出加计扣除政策对医药制造业发展取得的成效与当前政策在制定层面存在的局限性,例如加计扣除政策显著促进了医药制造业的生产资料规模与创新投入与产出的规模、对医药制造业利润总额的激励有限、当前研发费用的归集口径存在差异等。再次,结合理论分析与现状分析,实证分析了我国研发费用加计扣除政策对我国医药制造业企业发展的影响。利用Stata 16对所选面板数据进行固定效应回归,而后进一步按企业经营范围将医药制造业分为生物制品、中药制药、化学制药并对其进行异质性检验,更深入地分析研发费用加计扣除政策对不同医药制造业企业发展能力的影响效应;结果显示,研发费用加计扣除政策显著促进了医药制造业企业当年的生产能力与创新能力,而企业当年盈利情况与加计扣除政策之间无显著关系。异质性检验结果显示,加计扣除政策对促进企业创新能力方面存在行业内部差异,生物制品企业对研发费用加计扣除政策反映更加敏感,而政策对中药企业创新能力无显著促进作用。对于研发费用加计扣除政策对当年企业盈利能力不显著的情况,本文结合申请优惠的实际情况,引入滞后一年期变量再次进行回归分析,证明研发费用加计扣除政策对企业盈利能力的促进作用存在时滞性。最后,本文将总体样本变量进行1%水平上的双边缩尾处理进行稳健性分析,避免由于样本中异常值对实证结果产生影响。最后,本文依据我国当前研发费用加计扣除政策的现实情况、实证分析的结果得出研究结论,并在考虑我国国情的基础上提出了相应的优化路径:统一费用归集口径,提高优惠政策的普惠性、提升医药制造企业研发费所得税优惠政策激励效应、提前加计扣除优惠政策申报、加强税收监督,提高研发成果转化率。纵观本文,创新之处在于对研发费用加计扣除的政策效应从多个维度进行评价,采用更加全面的关于医药制造业企业发展能力的指标体系,全面衡量医药制造业的发展水平。从实证分析的角度,全面地体现研发费用加计扣除再次对医药制造业发展造成的影响。不足之处一是本文实证数据只选取了 A股上市公司的数据,可能会使实证结果与医药制造业整个行业结果有所偏差;二是本文提出的研发费用加计扣除政策完善建议只是在基于大量理论材料的阅读和不充分实证分析的基础上提出的,其科学性和有效性有待进一步考量。