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小麦条锈病是我国小麦生产上的重要病害之一。合理使用抗病品种是防治小麦条锈病的经济有效措施。然而,品种抗锈性丧失是抗病品种应用中最突出的问题,研究表明小麦条锈菌新小种的产生和发展是引致小麦品种抗锈性丧失的主要原因。因而,弄清近年来我国小麦条锈菌主要小种及流行菌系的分子遗传关系以及监测小麦条锈菌生理小种的类型及小种组成的变化对于小麦条锈病的综合防治及抗病品种的选育具有重要的实际意义。来自陕西、甘肃、云南和山西等地近几年的监测结果表明,从出现的频率来看,条中32号仍是优势小种,但从变化趋势来看,Hybrid46类群出现的频率逐年下降,水源11类群呈逐年上升趋势,因此,本研究利用AFLP技术对我国近年来小麦条锈菌主要流行菌系,特别是水源11类群进行了DNA指纹分析和毒性分析;并用RAPD技术对水源11类群的8个致病类型进行了多态性分析,以寻找主要流行类型的特异性分子标记。具体研究结果如下:1.利用筛选出的19对引物中的10对引物对小麦条锈菌的12个生理小种或类型进行AFLP分析发现,不同引物的扩增条带数为23--61个,扩增片段分子量主要集中在200bp-750bp之间;在10对引物扩增得到的431个AFLP条带中,62﹪表现出多态性。2.利用AFLP技术对小麦条锈菌主要流行菌系特别是水源11类群的DNA多态性进行聚类分析并与毒性分析比较后表明:小麦条锈菌流行菌系之间无论是毒性特征还是DNA指纹特征都存在丰富的遗传变异,但二者是不相关的;水源11类群的不同类型之间并没有很近的亲缘关系,它们在遗传上不属于同一个来源。3.共选用了190条10碱基随机引物进行RAPD分析,发现其中94条引物可以得到稳定清晰的扩增图谱。对中国小麦条锈菌水源11类群的8个致病类型进行的RAPD分析显示:各致病类型间的遗传变异丰富,但一些基因组区段仍具有一定的保守性。4.本研究寻找到了水源11-14、水源11-4的特异性RAPD标记。通过对水源11-14特异RAPD片段的回收、克隆和测序,设计了一对特异PCR引物,并转化为SCAR标记。从以上实验结果来看,AFLP技术比较适合小麦条锈菌遗传分析和揭示小种(菌系)之间的亲缘关系。同时,通过规模寻找小麦条锈菌生理小种的特异性RAPD片段,可以建立起中国小麦条锈菌流行生理小种的分子鉴定、检测体系。